r - 带有 ROCR 包的 R 中的预测格式无效

Question

我在 R 中使用 ROCR 包。但我收到错误“预测（预测，标签）：预测格式无效。”

请告诉我解决方案。

这是代码：

install.packages("ROCR", dependencies=TRUE)
install.packages("vcd",  dependencies=TRUE)
library(ROCR)
library(vcd)
library(boot)

setwd("/Users/Documents/R")

presence <- read.csv("sampleAverages.csv")
background <- read.csv("amplePredictions.csv")
pp <- presence$Logistic.prediction                # get the column of predictions
testpp <- pp[presence$Test.or.train=="test"]       # select only test points
trainpp <- pp[presence$Test.or.train=="train"]   # select only train points
bb <- background$logistic

combined <- c(testpp, bb)                                    # combine into a single     vector
label <- c(rep(1,length(testpp)),rep(0,length(bb)))  # labels: 1=present, 0=random
pred <- prediction(combined, label)                    # labeled predictions
perf <- performance(pred, "tpr", "fpr")               # True / false positives, for ROC curve
plot(perf, colorize=TRUE)                                  # Show the ROC curve
performance(pred, "auc")@y.values[[1]]            # Calculate the AUC

Answer 1

那可能是因为您的数据类别错误。尝试将预测数据修改为仅一列，例如 combine[,2] 或 label[,2]

Answer 2

检查两个对象的类别（标签和组合），您会发现它们不一样。然后，您可以使用dimRid <- combined[,1] 将具有不同维度的子集