我一直在尝试通过 R 从 PostgreSQL 数据库中查询数据。我尝试用几个不同的包(RODBC, RJDBC, DBI, RPostgres
等)给猫剥皮,但我似乎不断收到驱动程序错误。奇怪的是,我从来没有遇到过使用相同的驱动程序/URL 和设置从 SQLWorkbench/J 连接到 Postgres 的问题。
我尝试使用postgresql-9.2-1002.jdbc4.jar
andpostgresql-9.3-1100.jdbc41.jar
以及"PostgreSQL"
R 中的通用驱动程序。这两个 jar 文件分别是 (i) 我一直使用 SQLWorkbench/J 的驱动程序和 (ii) 同一驱动程序的稍新版本. 然而,当我尝试使用它时......
drv_custom <- JDBC(driverClass = "org.postgresql.Driver", classPath="/Users/xxxx/postgresql-9.3-1100.jdbc41.jar")
我收到一个错误:
Error in .jfindClass(as.character(driverClass)[1]) : class not found
好的,接下来我尝试使用通用驱动程序:
drv_generic <- dbDriver("PostgreSQL")
奇怪的是,它不希望我输入用户名:
>con <- dbConnect(drv=drv_generic, "jdbc:postgresql://xxx.xxxxx.com", port=xxxx, uid="xxxx", password="xxxx")
>Error in postgresqlNewConnection(drv, ...) : unused argument (uid = "xxxx")
所以我在没有用户/uid的情况下尝试:
con <- dbConnect(drv_generic, "jdbc:postgresql://padb-01.jiwiredev.com:5439", password="paraccel")
并得到一个错误....
Error in postgresqlNewConnection(drv, ...) :
RS-DBI driver: (could not connect jdbc:postgresql://padb-01.xxx.com:5439@local on dbname "jdbc:postgresql://xxxx.xxxx.com:5439")
显然语法错误?
然后我回到尝试“自定义”驱动程序(之前的 .jar 文件之一)但没有指定 driverClass。
drv_custom1 <- JDBC(classPath="/Users/xxxx/postgresql-9.2-1002.jdbc4.jar")
con <- dbConnect(drv=drv_custom1, "jdbc:postgresql://xxx.xxx.com", port=5439, uid="paraccel", pwd="paraccel")
并得到这个错误:
Error in .jcall(drv@jdrv, "Ljava/sql/Connection;", "connect", as.character(url)[1], :
RcallMethod: attempt to call a method of a NULL object.
我又试了一次,对语法稍作改动:
con <- dbConnect(drv=drv_custom1, url="jdbc:postgresql://xxxx.xxxx.com", port=xxxx, uid="xxxx", pwd="xxxxx",dsn="xxxx")
并得到同样的错误。我也尝试了许多其他变体/方法。我认为我的部分困惑来自这样一个事实,即在 DBI 之类的包和 RJDBC 等基于它的包之间以非常零碎的方式处理文档,因此当我查看文档时,例如?dbConnect
我需要指定的许多选项甚至都没有提到,我一直在根据与这些包/错误相关的杂项 Google 搜索结果进行工作。
我发现的一个线程建议尝试
.jaddClassPath( "xxxxx/postgresql-9.2-1002.jdbc4.jar" )
首先,但这似乎没有帮助。
我也尝试过使用
x <- PostgreSQL(max.con = 16, fetch.default.rec = 500, force.reload = FALSE)
无济于事,我尝试使用 RODBC 作为驱动程序。
更新:
我尝试使用旧版本的驱动程序(jdbc3 而不是 jdbc4),重新启动 R,并分离所有不必要的包。
我能够加载驱动程序
> drv_custom <- JDBC(driverClass = "org.postgresql.Driver", classPath="/xxxxx/xxxxx/postgresql-9.3-1100.jdbc3.jar")
但我仍然无法连接...
> con <- dbConnect(drv=drv_custom, "jdbc:postgresql://xxxxx.xxxxx.com", port=5439, uid="xxxxx", pwd="xxxxx")
Error in .verify.JDBC.result(jc, "Unable to connect JDBC to ", url) :
Unable to connect JDBC to jdbc:postgresql://xxxxx.xxxx.com