0

我在 Mac 上有点菜鸟，我的 python 安装拒绝承认我的 mac 上存在 rpy2 模块。看起来它只将其视为 Python 2.6 模块。如何使其在 2.7 中可见？我需要降级我的 python 吗？如果是这样，如何？在 RPy2 网页 ( http://rpy.sourceforge.net/rpy2_download.html ) 上，推荐使用 Python 2.6。谢谢！

mayumi@MAYUMI-iMac~:/ python --version
Python 2.7.6
mayumi@MAYUMI-iMac~:/ pip install rpy2
Requirement already satisfied (use --upgrade to upgrade): rpy2 in /Library/Python/2.6/site-packages/rpy2-2.3.8-py2.6-macosx-10.6-universal.egg
Cleaning up...
mayumi@MAYUMI-iMac~:/ python
Python 2.7.6 (v2.7.6:3a1db0d2747e, Nov 10 2013, 00:42:54) 
[GCC 4.2.1 (Apple Inc. build 5666) (dot 3)] on darwin
Type "help", "copyright", "credits" or "license" for more information.
>>> import rpy2
Traceback (most recent call last):
  File "<stdin>", line 1, in <module>
ImportError: No module named rpy2
>>>
4

2 回答 2

1

您可以看到 pip 安装到 python 2.6 的站点包，因为您使用 python 2.6 安装了 pip，它将默认使用该库。

 rpy2 in /Library/Python/**2.6**/site-packages/rpy2-2.3.8-py2.6-macosx-10.6-universal.egg

您可以重定向 pip 安装位置或使用 easy_install2.7 应该在 /usr/local/bin/

于 2014-01-09T19:53:06.477 回答
1

我还发现很难rpy2在 OSX 机器上成功安装。有时有效，有时无效，这很烦人。我最终解决了Anaconda Python来自https://store.continuum.io/cshop/anaconda/的分发，以节省所有麻烦。自切换以来，安装rpy2从未失败。

默认安装Anaconda不包含rpy2，所以要运行安装命令，from Anacondafolder, binsubfolder

康达安装rpy2

取决于版本，您可能会收到一堆警告。只是忽略它们。

然后rpy2就可以了！当然，仅在 . ，而不是您可能已安装在您的机器上Anaconda python的其他版本下。python

在此处输入图像描述

rpy2您可以按照以下示例运行一些测试以确保工作正常：http: //nbviewer.ipython.org/urls/raw.github.com/ipython/ipython/3607712653c66d63e0d7f13f073bde8c0f209ba8/docs/examples/notebooks/rmagic_extension.ipynb

bash命令，在文件夹中运行/Users/YOUR_USER_NAME/anaconda/bin/：

user-Mac-Pro:bin user$ conda install rpy2

它说：

Conda package not available for rpy2, attempting to install via pip
Downloading/unpacking rpy2
 Downloading rpy2-2.3.8.tar.gz (185kB): 185kB downloaded
 Running setup.py egg_info for package rpy2

如果您尚未R安装，它会抱怨一些警告并R为您获取。然后可能会有一些其他的折旧警告取决于您安装的内容。

（我与 Continuum 没有任何关系）

于 2013-11-15T16:43:12.807 回答