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我必须解决一个问题（问题和代码如下），我在执行这个程序时遇到错误。

Traceback (most recent call last):
  File "C:/Python33/exercise1.py", line 9, in <module>
    for n in range[len(string) - k]:
TypeError: unsupported operand type(s) for -: 'int' and 'list'

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频繁词问题：在字符串中找到最频繁的 k-mers。

输入：一个字符串 Text 和一个整数 k。[XGMcKJXnoMhmuXcsjswaejVunrrsDhoiWEzXbiKoiYBEpVmhJszFWCFJAHLPzKfKBhWbCABPCTqASGvgquUtnwSeeYkXtLcbzMxvcsUwjmhHfexpEEhjhjzKvYdODZeCgrehxUnYqDwYMBxaFsYAqIFsBSZslMmTNXPovRtRbqFOhMXMUErCnRgjiBIovOWXxlkYInG]

输出：文本中所有最常见的 k-mer。

我设计的代码是：

k=open("dataset_3_6.txt").readlines()
import string
string = str()

for k in string:
  k = int(k)

kmer_count = {}
for n in range(len(string) - k):
  c = string[n:n+k]
  kmer_count[c] = kmer_count[c] + 1 if kmer_count.has_key(c) else 1

max = 0
max_kmer = []
for k,v in kmer_count.iteritems():
  if v > max:
    max_kmer = [k]
    max = v
  elif v == max:
    max_kmer += [k]

print("max_kmer")
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1 回答 1

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上面有很多问题：

import string

为什么要导入这个模块？你打算使用它吗？

string = str()

这隐藏了string模块，因此您永远无法再次使用它，并创建一个默认（即空）字符串（使用 更容易做到string = ''）。

for k in string:
    k = int(k)

由于string是空字符串，因此循环零次。

即使它不是空的，k = int(k)也不会有任何效果；你只是一遍又一遍地重新绑定循环变量。如果您想string用数字列表替换字符串，其中每个数字是字符串中相应字符的整数值，您需要通过创建一个空列表并调用 来构建一个列表，或者append使用列表理解（例如，string = [int(k) for k in string]）。我不知道这是否是你在这里真正想要做的。

无论如何，如果string不为空，则在循环之后，k将是字符串中最后一个字符的 int 值。但既然是，k还是open("dataset_3_6.txt").readlines()早点调用的结果。也就是说，它是一个行列表。所以，在这个：

for n in range(len(string) - k):

您正在尝试从数字 0 中减去该行列表。（请记住，您设置string为空字符串，因此它len是 0。）

我不知道你期望这会做什么。

部分困惑是你有无意义的变量名，并且你重复使用相同的名称来引用不同的东西。首先k是行列表。然后它是一个循环变量。然后……你显然打算把它变成别的东西，但我不知道是什么。然后，它是字典中的每个键。

于 2013-11-12T04:24:31.060 回答