在 SO 用户的多次建议之后,我终于尝试将我的代码转换为 using data.table
.
library(data.table)
DT <- data.table(plate = paste0("plate",rep(1:2,each=5)),
id = rep(c("CTRL","CTRL","ID1","ID2","ID3"),2),
val = 1:10)
> DT
plate id val
1: plate1 CTRL 1
2: plate1 CTRL 2
3: plate1 ID1 3
4: plate1 ID2 4
5: plate1 ID3 5
6: plate2 CTRL 6
7: plate2 CTRL 7
8: plate2 ID1 8
9: plate2 ID2 9
10: plate2 ID3 10
我想做的是DT[,val]
在id为“CTRL”时取平均值。
我通常会aggregate
使用数据框,然后使用match
将值映射回新列“ctrl”。
使用data.table
我可以得到的包:
DT[id=="CTRL",ctrl:=mean(val),by=plate]
> DT
plate id val ctrl
1: plate1 CTRL 1 1.5
2: plate1 CTRL 2 1.5
3: plate1 ID1 3 NA
4: plate1 ID2 4 NA
5: plate1 ID3 5 NA
6: plate2 CTRL 6 6.5
7: plate2 CTRL 7 6.5
8: plate2 ID1 8 NA
9: plate2 ID2 9 NA
10: plate2 ID3 10 NA
我真正需要的是:
DT <- data.table(plate = paste0("plate",rep(1:2,each=5)),
id = rep(c("CTRL","CTRL","ID1","ID2","ID3"),2),
val = 1:10,
ctrl = rep(c(1.5,6.5),each=5))
> DT
plate id val ctrl
1: plate1 CTRL 1 1.5
2: plate1 CTRL 2 1.5
3: plate1 ID1 3 1.5
4: plate1 ID2 4 1.5
5: plate1 ID3 5 1.5
6: plate2 CTRL 6 6.5
7: plate2 CTRL 7 6.5
8: plate2 ID1 8 6.5
9: plate2 ID2 9 6.5
10: plate2 ID3 10 6.5
最终我想使用更复杂的值选择,但我不知道如何选择特定值,运行一些函数,然后使用数据框将这些值映射回适当的行。