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我实现了以下过程，旨在写入一些文件并在写入完成后在每个文件的末尾打印一条消息：

# Print one file per piaf
output_dir_piafs <- "OUTPUT_dataset_piafs"
unlink(output_dir_piafs, recursive = TRUE, force = TRUE)
dir.create(output_dir_piafs)
for (i in 1:length(lst_sorted)) {
    sink()      # Generates warnings...
    filename <- paste(output_dir_piafs, "/piaf_", i, ".txt", sep="")
    sink(file = filename, append = TRUE)
    sink(type = "message")
    cat("  ", colnames(file1), "\n")

    for (j in 1:length(lst_sorted[[i]])) {
        cat(j, " ")
        lapply( lst_sorted[[i]][[j]], 
                function(x) { 
                    cat(as.character(x), " ")
                }
        )
        cat("\n")
    }

    ## back to the console
    sink()
    cat(paste(filename, "done !\n"))
    #flush(stdout())        # Tested, no particular effect
}

我的问题是，如果我不在sink()循环的最开始添加 a ，则标准输出 ( cat(paste(filename, "done !\n"))) 上的最终写入将无效。另一方面，提早添加sink()会产生我想避免的警告：

There were 50 or more warnings (use warnings() to see the first 50)
> warnings()
Warning messages:
1: In sink() : no sink to remove
2: In sink() : no sink to remove
3: In sink() : no sink to remove

有没有人知道 sink() 的行为方式和/或如何摆脱这些警告？

注意：我也尝试过try(sink(), silent=TRUE)，但该silent选项只能防止错误...

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2 回答 2

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你不用sink看?cat，直接写文件就可以了。

以下代码应该可以工作：

output_dir_piafs <- "OUTPUT_dataset_piafs"
unlink(output_dir_piafs, recursive = TRUE, force = TRUE)
dir.create(output_dir_piafs)
lst_sorted <- c(1,2,3)
file1 <- c(a=1, b=2, c=3)
for (i in 1:length(lst_sorted)) {
  filename <- paste(output_dir_piafs, "/piaf_", i, ".txt", sep="")
  cat("  ", colnames(file1), "\n", file=filename, append=T)
  for (j in 1:length(lst_sorted[[i]])) {
    cat(j, " ", file=filename, append=T)
    lapply( lst_sorted[[i]][[j]], 
           function(x) { 
             cat(as.character(x), " ", file=filename, append=T)
           }
           )
    cat("\n", file=filename, append=T)
  }
  cat(paste(filename, "done !\n"))
}

请注意，我设置了变量lst_sorted，file1以便使代码可重现。

该cat解决方案对您有用吗？

于 2013-11-07T13:23:17.343 回答
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我最终通过sink(type="output")在捕获中断时添加一个来解决这个问题 - Ctrl-C- （这使得标准输出的后续使用变得正确 - 否则将保持锁定/转移）：

tryCatch({

    # Print one file per piaf
    output_dir_piafs <- "OUTPUT_dataset_piafs"
    unlink(output_dir_piafs, recursive = TRUE, force = TRUE)
    dir.create(output_dir_piafs)
    for (i in 1:length(lst_sorted)) {
        filename <- paste(output_dir_piafs, "/piaf_", i, ".txt", sep="")
        sink(file = filename, append = TRUE)
        sink(type = "message")
        cat("  ", colnames(file1), "\n")

        for (j in 1:length(lst_sorted[[i]])) {
            cat(j, " ")
            lapply( lst_sorted[[i]][[j]], 
                    function(x) { 
                        cat(as.character(x), " ")
                    }
            )
            cat("\n")
        }

        ## back to the console
        sink(type="output")
        cat(paste(filename, "done !\n"))
    }

}, interrupt = function(ex) {

    ##cat("An interrupt was detected.\n")
    sink(type="output")            # Restore the standard output !
    ##print(ex)

}) # tryCatch()


另一种方法（基于user1981275和Karl Forner 的帮助）是：

tryCatch({

    # Print one file per piaf
    output_dir_piafs <- "OUTPUT_dataset_piafs_2"
    unlink(output_dir_piafs, recursive = TRUE, force = TRUE)
    dir.create(output_dir_piafs)
    for (i in 1:length(lst_sorted)) {
        filename <- paste(output_dir_piafs, "/piaf_", i, ".txt", sep="")
        f <- file(filename, 'w')
        cat("  ", colnames(file1), "\n", file=f)

        for (j in 1:length(lst_sorted[[i]])) {
            cat(j, " ", file=f)
            lapply( lst_sorted[[i]][[j]], 
                    function(x) { 
                        cat(as.character(x), " ", file=f)
                    }
            )
            cat("\n", file=f)
        }

        flush(f)
        close(f)
        ## back to the console
        cat(paste(filename, "done !\n"))
    }

}, interrupt = function(ex) {

    closeAllConnections()

}) # tryCatch()

该解决方案的最大优势在于不转移标准输出，这意味着即使没有捕捉到中断，标准输出仍保持活动状态。

请注意，仍然需要进行键盘中断处理以避免出现以下警告：

> warnings()
Warning message:
closing unused connection 3 (OUTPUT_dataset_piafs_2/piaf_16.txt)

据此?closeAllConnections：

“closeAllConnections”关闭（并销毁）所有用户连接，同时恢复所有“接收器”转移。

最后一点：这两种方法在文件写入方面没有真正的速度差异。

于 2013-11-07T14:35:15.017 回答