visualization - 在graphviz中将具有相同颜色的节点分组在一起

Question

我用networkx创建了一个图形，并将图形表示写入一个点文件，用graphviz显示。现在，节点具有颜色属性，我希望 graphviz 将具有相同颜色的节点彼此靠近。

例如，如果节点“soccer”和节点“football”的颜色都为“蓝色”，那么它们应该靠近在一起，而颜色为“绿色”的节点“baseball”不会靠近节点“soccer”和“football”

1. 如何在 Graphviz 中将具有相同颜色的节点拉得更近；因此形成颜色簇？

感谢您的所有帮助，如果您需要更多信息，请告诉我:)

Answer 1

您可以使用 PyGraphviz 使用带有“簇”的点进行布局。例如

import networkx as nx

G = nx.Graph()
G.add_node(1, color='blue', style='filled')
G.add_node(2, color='red', style='filled')
G.add_edge(1,2)
G.add_node(3, color='blue',style='filled')
G.add_node(4, color='red',style='filled')
G.add_edge(3,4)
G.add_edge(4,10)
G.add_path([10,20,30,40,50])

A = nx.to_agraph(G) # uses pygraphviz
red_nodes = [n for n,d in G.node.items() if d.get('color')=='red']
blue_nodes = [n for n,d in G.node.items() if d.get('color')=='blue']
A.add_subgraph(red_nodes, name = 'cluster1', color='red')
A.add_subgraph(blue_nodes, name = 'cluster2', color='blue')
A.write('colors.dot')
A.layout('dot')
A.draw('colors.png')