我是编程新手，所以请简单解释一下。
我有一个用 java 编写的大型 GNU 项目，其中包含 1000 多个源文件。我正在使用 netbeans，我想在其中一些文件中应用我自己的更改，但我想让我自己的代码与已经编写的代码分开。例如，有一个文件“Formula.java”包含大约 5000 行代码。如果我对其进行一些更改，以后将很难找到我的代码所在的位置。一开始真的很简单，因为我只需要编辑不到 5 个文件。但是现在我有 20 多个，而且我迷失在代码中，因为我不记得我在类中对哪些函数进行了更改。我的问题是：
如何让我的函数实现与已经编写的内容分开，但让我的代码覆盖某些目标函数的功能。