r - 删除用于合并 r 中的两个数据集的字符子字符串

Question

我有两个数据集要比较它们的相似性，比如 hapmap.table 和 crowd_genomes.table。我正在使用 merge() 函数搜索和检索类似的记录。但在 hapmap 文件中，染色体编号输入为 chr1 ， chr2 等，而其他仅表示为数字。在合并之前如何从整个数据集中删除字符 chr，非常感谢。

Answer 1

假设 chrom 是 hapmap.table 中的染色体编号列

gsub("^chr","",hapmap.table$chrom)

例子：

hh<-structure(list(hh = structure(1:3, .Label = c("chr12", "chr23", 
"chr45"), class = "factor")), .Names = "hh", row.names = c(NA, 
-3L), class = "data.frame")

 hh
     hh
1 chr12
2 chr23
3 chr45

hh$hh<- gsub("^chr","",hh$hh)

 hh
  hh
1 12
2 23
3 45