r - 在给定 2 个列表（一个给孩子，另一个给父母）时，努力尝试输出树关系

Question

这几天一直在挠头，但无济于事。在与教授做志愿者时，我偶然发现了这个问题：我有以下数据将生物体与其父母联系起来（表格可能有 n 个条目长）：

有机体 ID - (1,2,3,4,5,6,7)

亲代生物 ID - (N/A,1, N/A,2,2,4,3)

（所以有机体 1 有父母“N/A”（没有父母），organsim 2 有父母 1，3 有父母“N/A”，4 有父母 2，5 有父母 4，7 有父母 3）

所以配对数据（父[i]，子[i]），关系是：

1->2

2->4

2->5

4->6

3->7

鉴于这些数据，我想制作某种树形视觉效果，例如：http: //imgur.com/gyWC1R0。或者也许把它变成 newick 格式（http://en.wikipedia.org/wiki/Newick_format）

我一直在 R 中摆弄（没有特别的原因，我最近一直在使用 R），输入一个列表作为父 ID，另一个用于有机体 ID，但到目前为止我所有的尝试都是徒劳的。

如果有人遇到类似的问题，或者可以找出解决此问题的一般逻辑，将不胜感激。

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您可能可以手动制作树状图，如以下问题所示：

但是，我建议查看 R 的 kinship2 包。

http://alexchubaty.com/index.php/2011/11/constructing-pedigrees-in-r/向您展示了如何制作家谱（这听起来像是您正在尝试做的事情）。

不幸的是，我对这个包裹不是很有经验，而且我不确定如何只有一个父母。

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