cluster-computing - 量子和分子动力学包和排队系统

Question

从 Quantum 和 Molecular Dynamics 软件包的扩展列表中，哪些可以轻松“互连”到与排队系统 PBS 和 Sun Grid Engine 一起工作的集群？

或者是否有一些程序或方法允许以 PBS 或 SGE 方式“打包”所有工作？

谢谢

Answer 1

如果您列表中的许多软件包无法在 PBS、SGE 或两者下的集群上轻松运行，我会感到非常惊讶。在最简单的情况下，它们只是批处理作业管理器，因此如果您可以编写命令行来执行您选择的程序，您就可以编写一个作业脚本来提交。使用 SGE，我对 PBS 不太熟悉，您甚至可以在集群上运行交互式作业。

您可能想了解在 PBS 和 SGE 下执行包的并行版本。同样，如果 (a) 包被并行化并且 (b) 集群配置了正确的并行化系统，则非常简单。

如果您可能对特定软件包有任何更具体的问题，您可以尝试再次发布，尽管我怀疑该软件包的生产者或其网站是比 SO 更好的起点。