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我写了一个 bash 脚本，我收到了这些消息：

/home/myname/documents/myscripts/run_tearingmode.sh：第 44 行：mpirun2：找不到命令：

这里是脚本的相关部分

if [[ "$run_jobs" == "y" ]]
 then
 printf "The jobs run one after the other. Have fun with the analysis. \n "
 for ((i=1;i<=$number_subfolders;i++))
  do
  sub_folder=${main_folder}_$i
  cd
  cd gkw/run/${main_folder}/$sub_folder #change into certain subfold
  pwd
  mpirun2 -np 8 ./gkw_btppx-gnu-DP_3481.x  #run on all 8 frames #line 44 Here is the problem 
  cd
 done
fi

我的问题是，当我在某个文件夹中仅作为命令键入该行时，程序运行正常。这向我表明我正确地实现了它。使用 pwd 我也知道我在正确的文件夹中。我没有发现我在哪里犯了错误。我需要在脚本中使用某个括号或等效的东西来运行程序吗？我还删除了命令前面的空白，但没有任何改变。有什么问题/遗漏？

编辑：问题是，您不能在这样的脚本中从 bashrc 运行别名。所以我补充说：

mpirun2='/Path/to/mpirun'

到我的脚本并将脚本中的命令更改为：

"$mpirun2" -np 8 ./gkw_btppx-gnu-DP_3481.x  #run on all 8 frames

这行得通。非常感谢。（不幸的是，我自己不能写这个答案作为首发:)）

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2 回答 2

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如果 mpirun2 不在用户的 PATH 上（'which -a' 将不返回任何内容）。您必须使用完整路径调用它：

/full/path/to/mpirun2 -np 8 ./gkw_btppx-gnu-DP_3481.x
于 2013-10-10T13:36:17.357 回答
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我想如果你在脚本顶部添加一个 shebang

#/usr/bin/env bash

和你的可执行文件的完整路径（这个命令显示它which mpirun2）这应该可以工作。

于 2013-10-10T13:19:45.413 回答