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首先,如果我的格式不正确,我深表歉意,我对编写脚本非常陌生(3 天),这是我在这个网站上的第一篇文章。

我有两个制表符分隔的文件,File a包含 14 列,并File b包含 8 列。

中的一列File b有一个数值,该数值与 中的两个数值字段生成的数字范围相关File a。对于 中的每一行File a,我需要搜索File b并打印两个文件中字段的数据组合。File a由于接受了数字范围,因此每行将有多个匹配项。

我创建的代码完全符合我的要求,但仅适用于 的第一行File a,并且不会继续循环。我已经查看了整个互联网,我相信这可能与这两个文件都是从标准输入读取的事实有关。我试图纠正这个问题,但我似乎无法得到任何工作

我目前的理解是,通过将一个文件更改为从不同的文件描述符中读取,我的循环可能会工作......>$3但我并不真正理解这一点,尽管我进行了研究。或者可能使用grep我也在努力的功能。

这是我现在使用的代码的大纲:

use strict;  
use warnings;

print "which file read from?\n";
my $filea = <STDIN>;  
chomp $filea;  
{
  unless (open ( FILEA, $filea) {
      print "cannot open, do you want to try again? y/n?\n?";  
      my $attempt = <STDIN>;  
      chomp $again;  
      if ($again =~ 'n') {
          exit;  
      } else {
          print "\n";   
          $filea = <STDIN>;  
          chomp $filea;  
          redo;  
      }
   }
}

#I also open fileb the same way, but wont write it all out to save space and your time.

my output = 'output.txt';  
open (OUTPUT, ">>$output");    

while (my $loop1 = <FILEA>) {  
    chomp $loop1;
    ( my $var1, my $var2, my $var3, my $var4, my $var5, my $var6, 
      my $var7, my $var8, my $var9, my $var10, my $var11, my $var12, 
      my $var13, my $var14 ) = split ( "\t", $loop1);

  #create the range of number which needs to be matched from file b.
  my $length = length ($var4);  
  my $range = ($var2 + $length);

  #perform the search loop through fileb
  while (my $loop2 = <FILEB>) {
      chomp $loop2;
    ( my $vala, my $valb, my $valc, my $vald, my $vale, my $valf, 
      my $valg) = split ( "\t", $loop2 );

    #there are then several functions and additions of the data, which all work basicly so I'll just use a quick example.

    if ($vald >= $val3 $$ $vald <= $range) {
        print OUTPUT "$val1, $vald, $val11, $valf, $vala, $val5 \n";
    }
  }
}

我希望这一切都是有道理的,如果有人可以帮助我编辑代码,以便循环继续通过所有 filea,我会尽量让一切变得清晰。

如果可能,请解释你做了什么。理想情况下,如果可以在不过多更改代码的情况下获得此结果,我会喜欢它。

多谢你们!!!

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1 回答 1

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  1. 尽可能避免裸露的把手;使用 $fh(文件句柄)而不是 FH

  2. 您可以使用 until 而不是 unless,并跳过重做:

    print "Enter the file name\n";
    my $file_a = <STDIN>;
    chomp $file_a;
    my $fh_a;
    until(open $fh_a, '<', $file_a) {
        print "Re-enter the file name or 'n' to cancel\n";
        $file_a = <STDIN>;
        chomp $file_a;
        if($file_a eq 'n') {
            exit;
        }
    }
    
  3. 您可以(应该)使用数组而不是所有这些单独的列变量:my @cols_a = split /\t/, $line;

  4. 您应该一次将文件 B 读入一个数组,然后在每次需要时搜索该数组:my @file_b = <$fh_b>;

  5. 结果将如下所示:

    #Assume we have opened both files already . . .
    my @file_b = <$fh_b>;
    chomp @file_b;
    while(my $line = <$fh_a>) {
        chomp $line;
        my @cols_a = split /\t/, $line;
        #Remember, most arrays (perl included) are zero-indexed,
        #so $cols_a[1] is actually the SECOND column.
        my $range = ($cols_a[1] + length $cols_a[3]);
    
        foreach my $line_b (@file_b) {
            #This loop will run once for every single line of file A.
            #Not efficient, but it will work.
            #There are, of course, lots of optimisations you can make
            #(starting with, for example, storing file B as an array of array
            #references so you don't have to split each line every time)
            my @cols_b = split /\t/, $line_b;
            if($cols_b[3] > $cols_a[2] && $cols_b[3] < ($cols_a[2] + $range)) {
                #Do whatever here
            }
        }
    }
    
于 2013-10-03T20:29:46.217 回答