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我正在使用 heatmap.2 来获取三角形热图(矩阵的上部被删除)。

我使用了这段代码: my_data_t <- t( as.matrix(my_data) )

`cor.matrix <- cor( my_data_t, method = "spearman")`

`cor.matrix[upper.tri( cor.matrix )] <- NA`

`my.col <- c( "blue", "green", "yellow", "orange", "red" )`

`my.breaks <- c( 0, 0.2, 0.6, 0.8, 1 )`

`hm2 <- heatmap.2( cor.matrix, scale="none", Rowv=NA, Colv=NA, 
                  col=my.col, breaks=my.breaks, margins(5,5),
                  cexRow=0.5,cexCol=1.0,key=TRUE,keysize=1.5, 
                  trace="none")`

my_data 是这样的: my_data <- "Taxon NO8.4 NO6.1 NO7.3 NO9.4 N09.7 a 0.1 0.05 0.01 0.2 0.06 b 0.0 0.8 0.8 0.0 0.0 c 0.7 0.0 0.0 0.0 0.1 d 0.0 0.01 0.08 0.0 0.09 e 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 f 0.09 0.05 0.01 0.04 0.0 g 0.07 0.7 0.0 0.01 0.08"

现在我想在热图的右边有颜色键,我想让它更大(作为热图右边的一个栏,只要这个)。功能上可以吗heatmap.2??

我也尝试使用该legend()命令,但在我看来它只能生成框图例,每种颜色都有一个框,所以没有唯一的侧栏,对吗?

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1 回答 1

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在此处查看答案: 在 R heatmap.2 中移动颜色键(gplots 包的功能)

不幸的是,您无法做的是旋转密钥,这似乎是您在这种情况下想要做的事情。

于 2015-07-14T17:16:00.823 回答