如何从 PDB 数据库中获取高度相似的结构？
假设 98% 或更高的序列相似结构？
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如果您对某个特定的蛋白质感兴趣，您应该首先创建一个同源模型以在数据库中搜索相似的蛋白质。这样做之后，您可以应用更严格的标准来获得高度相似的结果。查看瑞士模型来做到这一点。 http://swissmodel.expasy.org/
于 2013-09-30T17:41:25.757 回答
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您可以对您的序列进行 BLAST 搜索 ( http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi )，指定蛋白质数据库作为您正在搜索的数据库。
于 2014-06-15T05:55:30.327 回答