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我是一名 bash 程序员新手，在 SGE HPC 集群上提交数组作业时遇到了一些困难。我在集群上使用 R 模块来运行我编写的自定义分析例程（“CIfinal.rFunc”）。该脚本是功能性的，但我不熟悉编写 shell 脚本。这是我编写 shell 脚本的尝试：

#!/bin/bash

#$ -S /bin/bash
#$ -V
#$ -cwd
#$ -j y
#$ -N R-job
#$ -t 1-6

source /apps1/modules/init/sh
module purge
module load R/intel/3.0.1

parameters=(1 2 3 4 5 6)

#n_parameters=${#parameters[@]}
#for((i=1; i<$n_parameters; i++)); do
#    echo ${parameters[i]}
#
#done

#exit

index=$(($SGE_TASK_ID - 1))

arg1=${parameters[$index]}

cd $HOME/rDAT

cat <<EOF | R --no-save -q 
load("CIfinal.rFunc")
CIfinal.rFunc($arg1, 1)
EOF

exit

此脚本返回错误：第 26 行：参数：错误的数组下标这指的是 arg1=${parameters[$index]} 行

在我看来，参数没有被传递给函数，因此循环中的语法或bash命令之一或两者都必须有一些东西。

任何帮助将不胜感激。

谢谢

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