这可能是一种特殊情况,但您应该能够使用 numpy digitize。这里需要注意的是,箱子必须单调递减或递增。
>>> import numpy
>>> a = numpy.array([10,7,2,0])
>>> b = numpy.array([10,9,8,7,6,5,4,3,2,1])
>>> indices = [numpy.where(a<=x)[0][0] for x in b]
[0, 1, 1, 1, 2, 2, 2, 2, 2, 3]
>>> numpy.digitize(b,a)
array([0, 1, 1, 1, 2, 2, 2, 2, 2, 3])
时序测试的设置:
a = np.arange(50)[::-1]
b = np.random.randint(0,50,1E3)
np.allclose([np.where(a<=x)[0][0] for x in b],np.digitize(b,a))
Out[55]: True
一些时间安排:
%timeit [np.where(a<=x)[0][0] for x in b]
100 loops, best of 3: 4.97 ms per loop
%timeit np.digitize(b,a)
10000 loops, best of 3: 48.1 µs per loop
看起来速度提高了两个数量级,但这在很大程度上取决于垃圾箱的数量。你的时间会有所不同。
为了与 Jamie 的回答进行比较,我对以下两段代码进行了计时。因为我主要想关注searchsorted
vs的速度,digitize
所以我稍微减少了 Jamie 的代码。相关的块在这里:
a = np.arange(size_a)[::-1]
b = np.random.randint(0, size_a, size_b)
ja = np.take(a, np.searchsorted(a, b, side='right', sorter=a)-1)
#Compare to digitize
if ~np.allclose(ja,np.digitize(b,a)):
print 'Comparison failed'
timing_digitize[num_a,num_b] = timeit.timeit('np.digitize(b,a)',
'import numpy as np; from __main__ import a, b',
number=3)
timing_searchsorted[num_a,num_b] = timeit.timeit('np.take(a, np.searchsorted(a, b, side="right", sorter=a)-1)',
'import numpy as np; from __main__ import a, b',
number=3)
这有点超出了我有限的 matplotlib 能力,所以这是在 DataGraph 中完成的。我已经绘制了timing_digitize/timing_searchsorted
大于零的值的对数比searchsorted
更快,小于零digitize
的值更快。颜色也给出了相对速度。例如,在右上角 (a = 1E6, b=1E6)digitize
中显示慢了约 300 倍,searchsorted
而对于较小的尺寸digitize
可以快 10 倍。黑线大致是盈亏平衡点:
看起来searchsorted
对于大型案例来说,原始速度几乎总是更快,但是digitize
如果 bin 的数量很少,简单的语法几乎一样好。