r - 减少 heatmap.2 图上的列宽

Question

我有一个 331*9 双矩阵（名为 expr001）。它看起来像这样：

row.names     Col1      Col2      Col3      Col4      Col5      Col6    Col7       Col8      Col9
17211382  7.397439  7.377975  7.299997  8.192889  8.292300  8.092921  8.178948  8.120986  8.276824
17211752  9.115307  9.116741  9.113366  8.423073  8.458392  8.573309  8.773752  8.614159  8.592105
17212229  5.968911  6.060437  6.059898  5.595364  5.471327  5.538794  5.584753  5.518935  5.498830
17215629  8.641765  8.810358  8.770533  7.482992  7.732727  7.811839  8.582255  8.404402  8.357516
17215820 11.495858 11.605611 11.529879 11.124909 11.107311 11.179045 11.165894 11.188668 11.210991

我正在使用 heatmap.2 生成热图

heatmap.2(expr001,main="\n331 Genes : P.adj<0.01",cexCol=0.9,tracecol=NULL,col="bluered")

我得到下面的情节：

如何减小列的宽度？有什么建议么？

Answer 1

试试pheatmap包。在那里，您可以更方便地控制单元格的大小，使用参数cellwidth和cellheight. 即使您的绘图以这种方式变得太大并且不适合绘图窗口，那么通过使用参数filename您可以将其写入具有正确测量值的文件中。