alignment - 使用缝合 MAF 块时 MAF 类型为空（https://main.g2.bx.psu.edu/）

Question

我们在https://main.g2.bx.psu.edu/上使用 Galaxy Stitch MAF 块功能。

1）生成我的小说组装成绩单的BED文件（基于人类参考基因组的坐标。下面称为“human_refseq_nooverlap_bed”的文件）；

2) 登录银河网站。获取数据 -> 上传文件 -> 文件格式：“bed”，文件：单击并选择“human_refseq_nooverlap_bed”，基因组：“Human Feb. 2009 (GRCh37/hg19) (hg19)”

3) Fetch Alignments -> Stitch MAF blocks -> 选择区间：“human_refseq_nooverlap_bed”，MAF Source：“Locally Cached Alignments”；

4) MAF 类型为空。你能帮帮我吗，谢谢。

Answer 1

在您的 BED 文件中，检查编辑属性框中的自动检测。然后再次运行 MAF，它应该可以工作了！