我正在尝试更新“nlme”包，以便我可以在 gls 命令中使用较大的圆形距离进行关联。我正在尝试使用此处指定的更改来编辑源代码。
我不确定如何使用更新的源代码重新编译包。我可以在 .tar.gz 中编辑源代码，但是当我尝试从本地文件夹安装包时，我收到：
Installing package into ‘C:/Users/HSRG1/Documents/R/win-library/3.0’
(as ‘lib’ is unspecified)
* installing *source* package 'nlme' ...
files 'R/corStruct.R', 'R/gls.R', 'R/lme.R' have the wrong MD5 checksums
** libs
*** arch - i386
ERROR: compilation failed for package 'nlme'
* removing 'C:/Users/HSRG1/Documents/R/win-library/3.0/nlme'
Warning messages:
1: running command '"C:/PROGRA~1/R/R-30~1.0/bin/x64/R" CMD INSTALL -l "C:\Users\HSRG1\Documents\R\win-library\3.0" "nlme_3.1-111.tar.gz"' had status 1
2: In install.packages("nlme_3.1-111.tar.gz", repos = NULL, type = "source") :
installation of package ‘nlme_3.1-111.tar.gz’ had non-zero exit status
函数 R/corStruct.R'、'R/gls.R'、'R/lme.R 是我要编辑的函数。我不知道这个错误是什么意思，尤其是校验和不正确的问题（我怀疑其他错误会随之而来）。我找到了以下链接：http : //r.789695.n4.nabble.com/R-3-0-0-wrong-MD5-checksums-for-Windows-td4663348.html 讨论了一个不同的换行命令从 Windows 编译时，但我不知道这是如何相关（或可解决的），因为源没有换行声明。显然我缺少一些东西。
我使用的是 Windows 64 位计算机 - 如果我需要提供任何其他信息，请告诉我。
更新：正如建议的那样，我尝试在 ramps 包中实现 corRGaus 相关性。当我尝试使用 corRGaus 相关性时，出现以下错误：
y = runif(50, 1, 40)
x = runif(50, 1,20)
LC= c(rep(1,25), rep(2,25))
lat = runif(50,-90,90)
long = runif(50,180,180)
fit <- lme(y ~ x,random = ~x|LC, cor = corRGaus(form = ~lat+long))
Error in `coef<-.corSpatial`(`*tmp*`, value = value[parMap[, i]]) :
NA/NaN/Inf in foreign function call (arg 1)
In addition: Warning messages:
1: In nlminb(c(coef(lmeSt)), function(lmePars) -logLik(lmeSt, lmePars), :
NA/NaN function evaluation
2: In nlminb(c(coef(lmeSt)), function(lmePars) -logLik(lmeSt, lmePars), :
NA/NaN function evaluation
3: In nlminb(c(coef(lmeSt)), function(lmePars) -logLik(lmeSt, lmePars), :
NA/NaN function evaluation
4: In nlminb(c(coef(lmeSt)), function(lmePars) -logLik(lmeSt, lmePars), :
我不确定这个错误是什么意思，也不知道如何补救。
附带说明一下，安装坡道后，我无法再使用 corGaus 相关性，直到重新启动 R（即使我分离了坡道包）。