java - 在java中存储多个序列文件

Question

我有包含 60 列和 182 行的序列文件。这些序列是正常的 DNA 序列，如 A、C、T、G，并且还包含 - 。我应该用什么来存储和检索它 java？拥有 String 类概念或其他东西会有用吗？

import java.io.*;
public class file 
{
public static void main(String args[]) throws Exception 
{
file fl=new file("FASTA71_5");
FileReader fr=new FileReader(fl);
BufferedReader br=new BufferedReader(fr);
String s;
while((s=br.readLine())!=null) 
{
System.out.println(s);
//System.out.println(s.replace("-","0").replace("G","1")); 
}
//System.out.println(s.replace("-","0").replace("G","1")); } } `enter code here`

Answer 1

使用列表。在每个列表元素中，您应该持有不同的序列。

http://docs.oracle.com/javase/6/docs/api/java/util/ArrayList.html