我有一个带有 R 源块的 org 文件。现在我想在我的服务器上远程执行一些或实际上全部。我按照 org 手册中的设置并使用 =dir:= 如下例所示(出于明显的原因,我没有显示我的用户名或服务器名称;但是我可以在没有密码的情况下连接,所以 ssh 设置是可以的) :
#+BEGIN_SRC R :dir /xxx@xxx: :exports both
system("hostname")
#+END_SRC
当我用 Cc Cc 评估这个时,我得到以下信息:
executing R code block...
Tramp: Encoding region using function `base64-encode-region'...done
Tramp: Decoding region into remote file /ssh:xxx@xxx:/var/folders/2m/4d7t6kwx0tn2p6blmf3l7_kh0000gn/T/R-30000dMv...done
byte-code: Couldn't write region to `/ssh:xxx@xxx:/var/folders/2m/4d7t6kwx0tn2p6blmf3l7_kh0000gn/T/R-30000dMv', decode using `base64 -d -i >%s' failed
显然远程文件夹存在一些问题,因为在我的服务器上我没有写入 /var 的权限,或者实际上 /var/folders 不存在,它只存在于我的 Mac 本地。
当我尝试使用 sh 时收到类似的错误消息:
#+BEGIN_SRC sh :dir /xxx@xxx: :export both
hostname
#+END_SRC
有人对此有解决方案吗?或在远程机器上执行 R 代码的替代方法?
我的 Emacs 版本是 24.3,org 8.0.7
提前感谢您的任何回复!
更新:
我发现下面的emacs org-mode 邮件列表似乎与我的问题有关。如果远程执行代码,确实 org 似乎使用了错误的文件名。我不知道如何解决这个问题,或者我是否可以自己找到解决方案......
更新:
远程执行 R 代码的另一种方法如下:
使用“Mx ssh”启动远程 ssh 连接,连接到您的服务器,在那里启动 R 并在远程缓冲区中调用“Mx ess-remote”。现在,当将远程 R 缓冲区的名称指定为“会话”时,它将远程执行代码:
#+BEGIN_SRC R :exports both :results output :session *ssh xxx*
system( "hostname" )
#+END_SRC
这将返回服务器的主机名(注意,上面的“xxx”将是您的服务器名)。 重要的 ":results value" 将导致与临时文件相同的问题,现在似乎只有 ":results output" 可以工作。
更新和解决方案:
所以这:results output
是要走的路。这也适用于:dir
远程代码执行。