5

我想要做的是创建一个动画,其中图形的节点随时间改变颜色。当我在 matplotlib 中搜索有关动画的信息时,我通常会看到如下所示的示例:

#!/usr/bin/python

import numpy as np
import matplotlib
import matplotlib.pyplot as plt
from matplotlib.animation import ArtistAnimation

fig = plt.figure(figsize=(8,8))
images = []
for i in range(10):
  data = np.random.random(100).reshape(10,10)
  imgplot = plt.imshow(data)
  images.append([imgplot])
anim = ArtistAnimation(fig, images, interval=50, blit=True)
anim.save('this-one-works.mp4')
plt.show()

所以我想我可以做这样的事情:

#!/usr/bin/python

import numpy as np
import networkx as nx
import matplotlib
import matplotlib.pyplot as plt
from matplotlib.animation import ArtistAnimation

G = nx.Graph()
G.add_edges_from([(0,1),(1,2),(2,0)])
fig = plt.figure(figsize=(8,8))
pos=nx.graphviz_layout(G)
images = []
for i in range(10):
  nc = np.random.random(3)
  imgplot = nx.draw(G,pos,with_labels=False,node_color=nc) # this doesn't work
  images.append([imgplot])
anim = ArtistAnimation(fig, images, interval=50, blit=True)
anim.save('not-this-one.mp4')
plt.show()

我坚持的是,在使用 nx.draw() 绘制图形之后,我可以获取适当类型的对象以放入传递给 ArtistAnimation 的数组中。在第一个示例中,plt.imshow() 返回 matplot.image.AxesImage 类型的对象,但 nx.draw() 实际上并没有返回任何内容。有没有办法让我得到一个合适的图像对象?

当然,完全不同的方法是受欢迎的(似乎在 matplotlib 中总是有很多不同的方法可以做同样的事情),只要我完成后可以将我的动画保存为 mp4。

谢谢!

——克雷格

4

1 回答 1

13
import numpy as np
import networkx as nx
import matplotlib
import matplotlib.pyplot as plt
from matplotlib.animation import FuncAnimation

G = nx.Graph()
G.add_edges_from([(0,1),(1,2),(2,0)])
fig = plt.figure(figsize=(8,8))
pos=nx.graphviz_layout(G)
nc = np.random.random(3)
nodes = nx.draw_networkx_nodes(G,pos,node_color=nc)
edges = nx.draw_networkx_edges(G,pos) 


def update(n):
  nc = np.random.random(3)
  nodes.set_array(nc)
  return nodes,

anim = FuncAnimation(fig, update, interval=50, blit=True)

nx.draw不返回任何内容,因此您的方法不起作用。最简单的方法是绘制nodesedges使用nx.draw_networkx_nodes以及nx.draw_networkx_edges返回PatchCollectionLineCollection对象。然后,您可以使用 更新节点的颜色set_array

使用相同的通用框架,您还可以移动节点(通过set_offsetsforPatchCollectionset_vertsset_segmentsfor LineCollection

我见过的最好的动画教程:http: //jakevdp.github.io/blog/2012/08/18/matplotlib-animation-tutorial/

于 2013-08-14T13:09:35.557 回答