r - 如何在 R 中用 NA 替换缺失的空格？

Question

我正在处理遗传数据，并且我有一个巨大的输出文件（制表符分隔的文本文件），在某些列中我有缺失值。这些被留下作为空白。

我想用 NA 或 (.) 更改空格。我怎样才能在 R 中做到这一点？

Answer 1

你真的试过读你的文件吗？在 下?read.table，它陈述的论点na.strings：

na.strings
要被解释为 NA 值的字符串的字符向量。空白字段也被认为是逻辑、整数、数字和复杂字段中的缺失值。

所以，我猜（代替可重复的例子）......

read.table("C:/myfile.txt , sep = "\t")

如果您在包含数据的列中有空格character，则可以显式设置na.strings = ""哪个应该使 R 将所有空格视为NA...

read.table("C:/myfile.txt , sep = "\t" , na.strings = "" )

Answer 2

假设您有一个名为 的数据框df和一个名为 的列，您可以通过和v1的组合将任何完全为空白的字符串重新编码为丢失：replace()grepl()

df$v1 <- replace(df$v1, grepl("^\\s*$", df$v1) == TRUE, NA)

正如@Cath here所述，该grepl部分在字符串的开头 (^) 和结尾 ($) 之间搜索字符串中的“0 个或多个”(*) 空格 (\s)。如果字符串与这些条件匹配，则视为TRUE，否则视为FALSE。

嵌套在replace函数中，然后，R 将重新编码任何符合这些标准的观察df$v1（即TRUE）作为缺失（即NA）。