我知道这是一个非常主观的问题，但我会尽量使其具体。不同类别的数据是
- 安装/初始化数据（例如安装路径、序列号、服务器端口、服务器地址...）
- 应用程序/目的数据（构建应用程序的数据）
- 配置数据（颜色、计算的某些阈值、语言等设置……）
安装数据必须保存在 ini 文件中，因为它应该无需代码或无需访问数据库即可编辑。
应用程序数据存储在数据库中。
现在的问题是：我应该将配置数据存储在同一个数据库中（使用 Hibernate）并混合不同类的数据 还是 将配置保存在另一个文件中（使用Preferences API）并分离这些类？
有问题的项目是一个运行多个模块的网络服务器，这些模块都应该可以访问相同的配置。