awk - 用 awk 打印三列，然后一组三列

Question

我想从一个更大的文件创建多个文件，按列划分。例如，我的较大文件的标题如下所示：

Name Chr Position SNP1A SNP1B SNP1C SNP2A SNP2B SNP2C SNP3A SNP3B SNP3C

我想创建这些文件：

Name Chr Position SNP1A SNP1B SNP1C

Name Chr Position SNP2A SNP2B SNP2C

Name Chr Position SNP3A SNP3B SNP3C

我一直在尝试使用 awk，但我对它有点新手，所以我的命令当前显示为：

for ((i=1; i<=440;i++)); do awk -f printindivs.awk inputfile done

printindivs.awk 在哪里： {print $1 $2 $3 $((3*$i)+1) $((3*$i)+2) $((3*$i)+3))}

我得到的输出表明我试图获得三组的方式是错误的：我该怎么做？

谢谢

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您只需一个简单的awk脚本即可轻松完成此操作：

$ awk '{for(i=4;i<=NF;i+=3)print $1,$2,$3,$i,$(i+1),$(i+2) > ("out"++j)}' file

输出文件将位于out[1..n]：

$ cat out1
Name Chr Position SNP1A SNP1B SNP1C

$ cat out2
Name Chr Position SNP2A SNP2B SNP2C

$ cat out3
Name Chr Position SNP3A SNP3B SNP3C

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