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我有一个带有不同行的大文件。

我感兴趣的线条看起来很相似:

lcl|NC_005966.1_gene_59 scaffold441.6   99.74   390 1   0   1   390 34065   34454   0.0  715
lcl|NC_005966.1_gene_59 scaffold2333.4  89.23   390 42  0   1   390 3114    2725    1e-138   488
lcl|NC_005966.1_gene_60 scaffold441.6   100.00  186 0   0   1   186 34528   34713   1e-95    344

现在我想得到模式'lcl | NC_'之后的行,但只要第三个单词(或行中的第n个单词)小于100。

(在这种情况下,前两行,因为他们刚刚得到了数字 99.74 和 89.23)

接下来,它们应该被保存到一个新文件中。

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这可以使它:

$ awk '$1 ~ /^lcl\|NC_/ && $3<100' file
lcl|NC_005966.1_gene_59 scaffold441.6   99.74   390 1   0   1   390 34065   34454   0.0  715
lcl|NC_005966.1_gene_59 scaffold2333.4  89.23   390 42  0   1   390 3114    2725    1e-138   488

它检查两件事: - 以:
开头的第一个字段。(感谢 Ed Morton 对之前的改进) - 第三场 <100: 。 lcl|NC_$1 ~ /^lcl\|NC_/$1~"^lcl|NC_"
$3<100

要保存到文件中,您可以执行以下操作:

awk '$1 ~ /^lcl\|NC_/ && $3<100' file > new_file
                                      ^^^^^^^^^^
于 2013-07-29T11:53:42.490 回答