r - 为什么 Rscript 无法运行 R 可以正常处理的 FSelector 脚本？

Question

这是个人记录，因为这个问题对谷歌来说很难，我想我会在几年后再次遇到它。

我有一个像这样的脚本：

library(FSelector)
table <- read.csv("somefile", header=0);
table <- table[,colSums(is.na(table))<nrow(table)]
imputed_table <- apply(table, 2, function(x){x <- replace(x, is.na(x), mean(x, na.rm=TRUE))});
nms <- colnames(table)
model <- information.gain(as.formula(paste(nms[length(nms)],"~.")), table)

运行时：

R --no-save < IG.R

这工作正常，并打印模型。

运行时：

Rscript ./IG.R

这会因错误而崩溃：

Error in .jarray(x) : could not find function "getClass"
Calls: information.gain ... read_model_frame_into_Weka -> read_data_into_Weka -> .jcall -> .jarray -> .Call
Execution halted

为什么会这样？

Answer 1

发生这种情况是因为 Rscript 默认不加载 rJava 库，这是 FSelector 所需的，但显然在加载 FSelector 时没有加载。相比之下，标准的“R”命令默认加载rJava。

要解决此问题，请添加：

library(rJava)

到 information.gain 调用之前的脚本。