r - cbind 与其中一个表中的重复行名

Question

我正在尝试按列合并两个数据集：

> x
   ID XD
1 sll0001 A
2 sll0002 B
3 sll0003 C

> y
   ID      XD
1 sll0001 go_0002
2 sll0001 go_0003
3 sll0003 go_0003
4 sll0003 go_0004
5 sll0004 go_0005

我想得到这样的东西：

> xy
   ID   XD    XD.1    XD.2
1 sll0001    A go_0002 go_0003
2 sll0002    B    <NA>    <NA>
3 sll0003    C go_0004    <NA>
4 sll0004 <NA> go_0005    <NA>

我的问题是 cbind() 不允许使用重复的行名。任何想法？谢谢！

Answer 1

使用data.table：

require(data.table)
xx <- data.table(x, key="ID")
yy <- data.table(y, key="ID")

idx <- seq_len(max(yy[, .N, by=ID]$N))
merge(xx, yy[, as.list(XD[idx]), by=ID], by="ID", all=TRUE)
        ID XD      V1      V2
1: sll0001  A go_0002 go_0003
2: sll0002  B      NA      NA
3: sll0003  C go_0003 go_0004
4: sll0004 NA go_0005      NA