r - 随机森林中的错误：“需要至少两个类来进行分类”

Question

我正在尝试做一个物种分布模型，我正在遵循 Robert J. Hijmans 和 Jane Elith 的指南“用 R 进行物种分布建模”。

一切似乎都很好，但是当我尝试运行 RandomForest 时，我收到以下错误消息：

"Need at least two classes to do classification". 

我正在使用的代码是：

library(randomForest)
model <- factor (pa) ~ Bio3 + Bio2 + Bio16 + Bio11 + aspect + depth + dem + my_epikrat + corine_2000
rfabies <- randomForest(model, data=envtrain, na.action=na.omit, ntrees=1000)


Error in randomForest.default(m, y, ...) :
  Need at least two classes to do classification.

什么可能导致这个问题？谁能帮我？

Answer 1

pa问题是转换为因子后您只有一个级别。很可能，您只有存在。

您可以通过以下方式检查：

table(factor(envtrain$pa))

如果您只有在场，则需要生成伪缺席。对于随机森林，这里建议使用与存在相同数量的伪缺失。