在这篇Wiki 文章中写道
NetCDF 用户可以创建 HDF5 文件
但是我很难找到如何实际进行这种转换。我唯一能找到的是http://www.hdfgroup.org/HDF-FAQ.html#convnetcdf。这里写道：
有一个来自 Fortner Software (defunct) 的名为 ncdf2hdf 的 Windows 可执行文件进行转换。它不再可用，但可以通过搜索网络找到。但是，据报道，它生成的 HDF 文件缺少上述路径生成的文件中的某些结构。
在这里我不应该提到，在网上很难找到这个 ncdf2hdf。
到目前为止，我发现我可以使用 python 通过http://gfesuite.noaa.gov/developer/netCDFPythonInterface.html或https://code.google.com/p/netcdf4-python/读取 netcdf 文件，但是有更简单的方法。
首先，查看您的文件使用的是哪种 netCDF 格式。如果您的系统上安装了 netCDF，最简单的方法是使用 ncdump：
ncdump -k foo.nc
如果 ncdump 返回netCDF-4, 或netCDF-4 classic model, 那么恭喜你, 你已经有了一个 HDF 文件, 因为 netCDF-4 是使用 HDF5 作为存储层实现的 netCDF 数据模型。这些文件可以通过 HDF 库版本 1.8 或更高版本准备好，据我所知，pytables。
如果 ncdump 返回classicor 64-bit offset，那么您正在使用 netCDF-3 并且需要转换为 netCDF-4（因此是 HDF）。好消息是，如果你安装了 netCDF，你可以很容易地进行转换：
nccopy -k 4 foo3.nc foo4c.nc
有关更多详细信息，请参阅netCDF 常见问题解答，特别是此条目。
也就是说，值得花时间学习如何使用 netCDF-4-python 来完成这项任务而无需中间转换（不要让名字欺骗了你，netCDF-4-python 可以读取 netCDF-3 格式，如以及大多数 netCDF-4 文件）。netCDF-3 仍然被广泛使用，即使在气象界之外，这个额外的箍在一段时间后会变得很麻烦。更重要的是，如果您的文件非常大，转换可能会变得非常耗时。