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我正在尝试使用在 Linux 机器上安装一些 R 包

R CMD INSTALL -l <ourRlibrarylocation> <path where I saved the packagename.tar.gz file>

我看到一条错误消息:

ERROR: a 'NAMESPACE' file is required

我正在使用 R 3.0.1。请帮忙,我是 R 新手,刚刚为客户下载了这些包。

一个例子:

 R CMD INSTALL -l /abcde/R/R-3.0.0/library /home/RFILES/PKG/UScensus2000tract_0.03.tar.gz
* installing *source* package âUScensus2000tractâ ...
ERROR: a 'NAMESPACE' file is required
* removing â/abcde/R/R-3.0.0/library/UScensus2000tractâ
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根据R编写扩展的文档,所有发往 3.0.0 及更高版本的包都必须包含一个NAMESPACE文件。如果您下载的R软件包会出现上述错误,那么您应该尝试以下方法:

解压包:

tar -xvf the_package.tar.gz

使用以下行添加NAMESPACE文件exportPattern( "." )

cd the_package
echo 'exportPattern( "." )' > NAMESPACE
cd ..

重新压缩包:

tar -zcf the_package.tar.gz the_package

再次尝试安装。

希望有帮助。

于 2013-09-03T11:03:06.003 回答
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实际上,我在编译 R-3.0.1 时遇到了同样的问题。看起来我使用的软件包版本已经过时了。这是为了proto

# /var/local/R-3.0.1/bin/R CMD INSTALL -l /var/local/R-3.0.1/lib64/R/library proto_0.3-9.2.tar.gz
* installing *source* package ‘proto’ ...
ERROR: a 'NAMESPACE' file is required
* removing ‘/var/local/R-3.0.1/lib64/R/library/proto’

但是有一个新版本的 proto (0.3-10) 运行良好:

# ../var/local/R-3.0.1/bin/R CMD INSTALL -l ../var/local/R-3.0.1/lib64/R/library proto_0.3-10.tar.gz
* installing *source* package ‘proto’ ...
** package ‘proto’ successfully unpacked and MD5 sums checked
** R
** demo
** inst
** preparing package for lazy loading
** help
*** installing help indices
** building package indices
** installing vignettes
   ‘proto.Rnw’
   ‘protoref.Rnw’
** testing if installed package can be loaded
* DONE (proto)

我有一个较旧的 R (2.15) 安装,较旧的 proto 包可以使用:

# /var/local/R-2.15.0/bin/R CMD INSTALL -l /var/local/R-2.15.0/lib64/R/library proto_0.3-9.2.tar.gz
* installing *source* package 'proto' ...
** Creating default NAMESPACE file
** R
** demo
** inst
** preparing package for lazy loading
** help
*** installing help indices
** building package indices
** installing vignettes
   'proto.Rnw'
   'protoref.Rnw'
** testing if installed package can be loaded

看起来旧版本的 R 实际上创建了丢失的 NAMESPACE 文件,但新版本保释了。希望这对你有帮助!

于 2013-07-10T20:58:39.477 回答
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我发现以下链接更有用: 我应该如何处理“package 'xxx' is not available (for R version xyz)”警告?

6. 包裹已过期

它可能已被归档(如果它不再维护并且不再通过R CMD check测试)。

在这种情况下,您可以使用加载旧版本的包install_version()

library(devtools)
install_version("foobarbaz", "0.1.2")

另一种方法是从 github CRAN 镜像安装。

library(devtools)
install_github("cran/foobarbaz")
于 2017-11-05T09:41:02.687 回答
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现在可以使用remotes::install_url()remotes::install_local()

它安装依赖项并NAMESPACE自动生成文件。

于 2019-10-24T09:32:07.000 回答