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我的包 CTDesignExplorer 使用了闪亮的（和闪亮的孵化器）。当我在说明文件中包含
Depends: shiny
时，在 RStudio 中加载包时会出现警告：

.simpleDuplicateClass(def, prev) 中的警告：“RJSONIO”包中 S3 类“AsIs”的规范似乎等同于 >package 'BiocGenerics' 中的规范，并且没有为此类打开重复的类定义

在命令行 R 中，加载闪亮会得到多个警告；除了“AsIs”，还有“connect”、“file”、“pipe”和“textConnection”。
在https://github.com/joey711/phyloseq/issues/128，该问题据说在 6 个月前就已解决，但即使在 update.packages("RJSONIO") 之后也是如此。版本为 1.0-3，从 2013-03-27 开始。
在https://stat.ethz.ch/pipermail/bioc-devel/2013-March/004177.html，建议是从 NAMESPACE 中删除 RJSONIO。但它不在我的包裹中（或在说明中）。在闪亮中，它位于描述中的导入下。

这可能对代码执行没有影响，但很难确定。无论如何，对于我的用户来说，这肯定是丑陋的。

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我认为在你的包中将 Shiny 从 Depends 切换到 Imports 可能会有所帮助。并且，如有必要，importFrom在您的 NAMESPACE 文件中使用来导入特定的 Shiny 函数，而不是引入所有 Shiny。

http://cran.r-project.org/doc/manuals/R-exts.html#Specifying-imports-and-exports

于 2013-06-19T03:18:06.357 回答