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我正在尝试构建一个使用一些 C 代码的 R 包。我有一个编译成可执行文件的 C 库,可以从命令行调用。有一个与之关联的 Makefile。

我试图在这里了解信息,它说

如果要创建然后链接到库,例如在子目录中使用代码,请使用类似

 .PHONY: all mylibs

 all: $(SHLIB)
 $(SHLIB): mylibs

 mylibs:
         (cd subdir; make) 

小心创建所有必要的依赖项,因为不能保证所有依赖项都将按特定顺序运行(并且一些 CRAN 构建机器使用多个 CPU 和并行制造)。

如果我在我的包中创建一个新的文件夹子目录,src名为导出使用?someLibraryMakevarsuseDynLib


编辑1:

按照此处的信息,我Makefile通过添加更改以创建共享库

CFLAG = -fPIC -g -O3 
LDFLAGS= -shared

但是这样会导致.so文件没有直接导出到libs包所在目录的问题。如果我将路径硬编码到目标中,那么文件将被发送到libs包的目录(这都是通过调用的方式R CMD INSTALL myPackage)。


编辑2:

最后,我想知道如何调用共享库,因为它有一个main()我可以从命令行可执行文件调用的方法。

将其公开给 RNAMESPACE以便可以通过调用它的过程是.Call什么?

PS。请让我知道我是否应该将最后一点作为一个单独的问题。

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原始问题作者在对问题的评论中询问了使用AutomakeLibtool并将LDADD在一个目录中编译的程序与在第二个目录中编译的共享库链接的示例。这是一个完整的、独立的、完整的示例,说明如何使用 GNU Autotools 在同一源代码树的不同目录中编译库和程序。

目录结构

我们需要建立一个目录结构如下:

├ A/
│ ├ Makefile.am
│ ├ helloworld.c
│ └ helloworld.h
├ B/
│ ├ Makefile.am
│ └ foo.c
├ configure.ac
└ Makefile.am

共享库将在目录中编译A/,使用它的程序在目录中B/

编写源代码

有三个源文件。

A/helloworld.c是库的源代码。它导出一个过程,say_hello(),打印消息“Hello world!” 到标准输出。

#include <stdio.h>
#include "helloworld.h"

void
say_hello (void)
{
  printf ("Hello world!\n");
}

A/helloworld.h是包含say_hello()函数声明的头文件。它只有一行:

void say_hello (void);

最后,B/foo.c是使用共享库的程序的源代码。它包括库的头文件,并调用say_hello().

#include <helloworld.h>

int
main (int argc, char **argv)
{
  say_hello ();
  return 0;
}

编译库

我们将使用 Automake 和 Libtool 来编译共享库。这两个工具都非常强大,并且实际上非常有据可查。手册(AutomakeLibtool)绝对值得一读。

A/Makefile.am文件用于automake控制库的编译。

# We're going to compile one libtool library, installed to ${libdir},
# and named libhelloworld.
lib_LTLIBRARIES = libhelloworld.la

# List the source files used by libhelloworld.
libhelloworld_la_SOURCES = helloworld.c

# We install a single header file to ${includedir}
include_HEADERS = helloworld.h

编译程序

B/Makefile.am文件控制库的编译。我们需要使用LDADD变量来告诉automake链接到我们之前编译的库。

# Compile one program, called foo, and installed to ${bindir}, with a single C
# source file.
bin_PROGRAMS = foo
foo_SOURCES = foo.c

# Link against our uninstalled copy of libhelloworld.
LDADD = $(top_builddir)/A/libhelloworld.la

# Make sure we can find the uninstalled header file.
AM_CPPFLAGS = -I$(top_srcdir)/A

控制构建

最后,我们需要一个顶层Makefile.am来告诉 Automake 如何构建项目,以及一个configure.ac文件来告诉 Autoconf 如何找到所需的工具。

顶层Makefile.am相当简单:

# Compile two subdirectories.  We need to compile A/ first so the shared library is
# available to link against.
SUBDIRS = A B

# libtool requires some M4 scripts to be added to the source tree.  Make sure that
# Autoconf knows where to find them.
ACLOCAL_AMFLAGS = -I m4

最后,该configure.ac文件告诉 Autoconf 如何创建configure脚本。

AC_INIT([libhelloworld], 1, peter@peter-b.co.uk)

# This is used to help configure check whether the source code is actually present, and
# that it isn't being run from some random directory.
AC_CONFIG_SRCDIR([A/helloworld.c])

# Put M4 macros in the m4/ subdirectory.
AC_CONFIG_MACRO_DIR([m4])

# We're using automake, but we want to turn off complaints about missing README files
# etc., so we need the "foreign" option.
AM_INIT_AUTOMAKE([foreign])

# We need a C compiler
AC_PROG_CC

# Find the tools etc. needed by libtool
AC_PROG_LIBTOOL

# configure needs to generate three Makefiles.
AC_CONFIG_FILES([A/Makefile
                 B/Makefile
                 Makefile])
AC_OUTPUT

测试一下

跑:

$ autoreconf -i
$ ./configure
$ make
$ B/foo

您应该会看到所需的输出:“Hello world!”

于 2014-03-04T20:15:54.667 回答
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可调用的.c

#include <stdio.h>

int main(int argc, char **argv) {
    printf("Hello World\n");
    return 0;
}

要从 C 文件 callable.c 中获取 .so 文件,请使用

R CMD SHLIB callable.c

所以现在我们有了 callable.so

R 通常要求所有 C 参数都是指针,但是如果您的 main 方法忽略 argc,那么我们可以解决这个问题。因此,要从 R 中调用 callable.so 中的 main,我们可以编写这样的方法。

main <- function() {
    dyn.load("callable.so")
    out <- .C("main", argc=0, argv="")
}

调用该主函数将运行 C 主函数。

于 2014-03-04T15:26:05.067 回答