我有一个由许多条目组成的文件，如下所示：
>1761420406686363113470.1
CAAGATTCTGAGATAATCGCGGTTTAAAGTTTCAAATTTGTTTCGGCCGATTCGAAGTCA
即以 > 开头的标题行和许多序列行，然后是标题行。我正在尝试编写一个 sed 脚本，该脚本仅转到以 > 开头的行（而不是序列行），并删除除前 10 个数字之外的所有数字。
有很多类似的问题，但我无法弄清楚。我一直在尝试对此代码的变体：
sed 's/^>..........*/^>........../' input.fasta
但显然我做得不对..
这可能对您有用（GNU sed）：
sed -r 's/^(>.{10}).*/\1/p;d' file
如果要保留序列行，这将删除除那些被替换的行之外的所有行：
sed -r 's/^(>.{10}).*/\1/' file
应该符合要求。
您必须捕获括号中的前 10 个字符：
sed -e 's/^\(>..........\).*/\1/'
可以缩短为
sed -e 's/^\(>.\{10\}\).*/\1/'
作为 sed 的替代品，使用 cut
$ echo ">1761420406686363113470.1" | cut -c1-11
>1761420406
要对以 开头的行进行操作>，请将其包装在 bash-while-loop 中
$ while read line; do if [[ $line == \>* ]]; then cut -c1-11 <<< $line; else echo $line; fi done < input
>1761420406
CAAGATTCTGAGATAATCGCGGTTTAAAGTTTCAAATTTGTTTCGGCCGATTCGAAGTCA
或使用 awk：
$ awk '{if ($0 ~ />/){print substr($0,0,11)}else{print}}' input
>1761420406
CAAGATTCTGAGATAATCGCGGTTTAAAGTTTCAAATTTGTTTCGGCCGATTCGAAGTCA
sed由于已经发布了好的答案，这里有一个 `GNU-awk 解决方案。
gawk '/^>/{print gensub(/(.{11}).*/,"\\1","G",$1);next }1' inputFile