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我正在尝试创建一个函数,该函数使用来自 pandas DataFrame 的新数据更新存储在 PyTable 中的 pandas DataFrame。我想检查 PyTable 中是否缺少特定 DatetimeIndexes 的某些数据(值为 NaN 或新的时间戳可用),将其替换为给定 pandas DataFrame 中的新值并将其附加到 Pytable。基本上,只需更新一个 Pytable。我可以使用 Pandas 中的 combine_first 方法获取组合的 DataFrame。Pytable 下面是用虚拟数据创建的:

import pandas as pd
import numpy as np
import datetime as dt
index = pd.DatetimeIndex(start = dt.datetime(2001,1,1,0,0), periods = 20000,freq='10T')
data_in_pytable = pd.DataFrame(index=index,data=np.random.randn(20000,2),columns=['value_1','value_2'])
data.to_hdf(r'C:\pytable.h5','test',mode='r+',append=True,complevel=9,complib='zlib')

所以创建了pytable。假设我有另一个数据帧,我想用它来更新 Pytable:

new_index = pd.DatetimeIndex(start = dt.datetime(2001,5,1,0,0), periods = 10000,freq='10T')
data_to_update=pd.DataFrame(index=new_index,data=np.random.randn(10000,2),columns=['value_1','value_2'])
store=pd.HDFStore(r'C:\pytable.h5',mode='r+',complevel=9,complib='zlib')
store.append('test',store.select('test').combine_first(data_to_update))
store.close()

问题是 PyTable 保留原始值,不更新现有值。我现在有重复的条目(按索引),因为原始值没有被覆盖。

摘要:如何使用另一个 DataFrame 更新 PyTable?

谢谢,精灵

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目前不支持此功能。PyTables确实支持一种update方法,但未在 pandas 中实现。

最简单的方法是使用mode='w'和编写一个新文件或

store.remove(key); store.append(.....)

HDF5不是“常规”数据库,更新不是常见操作,如果您需要 SQL 可能是一个选项。

随时请求update作为问题的增强。

于 2013-06-10T11:31:05.157 回答
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最后,我自己发现了。就我而言,当“combine_first”为您提供原始值和新值时可以覆盖整个节点时,可以使用

store.put(key,value,table=True,append=False) 

而不是

store.append(key,value).
于 2013-06-10T13:42:49.813 回答