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我安装了 Python2.7 并且在安装 scipy 时遇到了一些问题。通过一些谷歌搜索,我从这里的一个线程(在 mac 10.6.8 上安装 scipy)发现最好使用 MacPorts 和 IPython 安装 scipy。

IPython 看起来很酷,我想尝试一下。到目前为止,太好了——我感觉很棒,很高兴我可以自己做这一切。

现在,我用我的 Python2.7 安装了 Biopython(这个版本的 Python2.7 安装在一个文件夹中/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/lib/python2.7)。

在我过分热衷于尝试 Ipython 的过程中,我(认为)我在新目录中重新安装了 Python2.7,以及 IPython、scipy 等/opt/local/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/lib/python2.7

但是,现在我新安装的Python2.7中没有Biopython。那么新安装的Python2.7是否需要重新安装Biopython呢?

如果是,我如何将安装定向到该文件夹​​?

会不会像下面这样(比如我biopython-1.61.tar.gz在下载文件夹中有):

cd Downloads
tar -xzvpf biopython-1.61.tar.gz
cd biopython-1.61
/opt/local/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/bin/python setup.py install

我想知道我是否在这里。不想尝试搞砸我到目前为止所拥有的东西!

我有 Mac OS X V10.6.8。

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2 回答 2

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以下对我有用(来自MacPorts Python 安装在 Mac 上):

  1. 将我使用 MacPorts 执行的 Python2.7/iPython2.7 安装设为默认

    $ sudo port select --set python python27
    $ sudo port select --set ipython ipython27
    
  2. 通过 MacPorts 检查 Biopython 是否可用

    $ port search biopython
    
  3. 安装 Biopython

    $ sudo port install py27-biopython  # install Biopython
    
于 2013-06-07T04:22:04.817 回答
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对于 Python 新手来说,最困难的事情之一就是弄清楚所有包的安装。这是一项正在进行的工作,Python 社区正在积极讨论。

我建议使用商业发行版,它可以为您提供所需的一切,并且可以正常工作。通过这种方式,您可以开始学习使用 Python,而不必弄清楚如何让一切正常工作。

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于 2013-06-07T03:40:00.607 回答