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所以我正在读取来自 NOAA 的站代码 csv 文件,它看起来像这样:

"USAF","WBAN","STATION NAME","CTRY","FIPS","STATE","CALL","LAT","LON","ELEV(.1M)","BEGIN","END"
"006852","99999","SENT","SW","SZ","","","+46817","+010350","+14200","",""
"007005","99999","CWOS 07005","","","","","-99999","-999999","-99999","20120127","20120127"

前两列包含气象站的代码,有时它们有前导零。当 pandas 在没有指定 dtype 的情况下导入它们时,它们会变成整数。这没什么大不了的,因为我可以遍历数据帧索引并用类似的东西替换它们,"%06d" % i因为它们总是六位数,但你知道......这是懒惰的方式。

使用以下代码获取 csv:

file = urllib.urlopen(r"ftp://ftp.ncdc.noaa.gov/pub/data/inventories/ISH-HISTORY.CSV")
output = open('Station Codes.csv','wb')
output.write(file.read())
output.close()

这一切都很好,但是当我去尝试使用它阅读它时:

import pandas as pd
df = pd.io.parsers.read_csv("Station Codes.csv",dtype={'USAF': np.str, 'WBAN': np.str})

或者

import pandas as pd
df = pd.io.parsers.read_csv("Station Codes.csv",dtype={'USAF': str, 'WBAN': str})

我收到一条令人讨厌的错误消息:

File "C:\Python27\lib\site-packages\pandas-0.11.0-py2.7-win32.egg\pandas\io\parsers.py", line 401, in parser
_f
    return _read(filepath_or_buffer, kwds)
  File "C:\Python27\lib\site-packages\pandas-0.11.0-py2.7-win32.egg\pandas\io\parsers.py", line 216, in _read
    return parser.read()
  File "C:\Python27\lib\site-packages\pandas-0.11.0-py2.7-win32.egg\pandas\io\parsers.py", line 633, in read
    ret = self._engine.read(nrows)
  File "C:\Python27\lib\site-packages\pandas-0.11.0-py2.7-win32.egg\pandas\io\parsers.py", line 957, in read
    data = self._reader.read(nrows)
  File "parser.pyx", line 654, in pandas._parser.TextReader.read (pandas\src\parser.c:5931)
  File "parser.pyx", line 676, in pandas._parser.TextReader._read_low_memory (pandas\src\parser.c:6148)
  File "parser.pyx", line 752, in pandas._parser.TextReader._read_rows (pandas\src\parser.c:6962)
  File "parser.pyx", line 837, in pandas._parser.TextReader._convert_column_data (pandas\src\parser.c:7898)
  File "parser.pyx", line 887, in pandas._parser.TextReader._convert_tokens (pandas\src\parser.c:8483)
  File "parser.pyx", line 953, in pandas._parser.TextReader._convert_with_dtype (pandas\src\parser.c:9535)
  File "parser.pyx", line 1283, in pandas._parser._to_fw_string (pandas\src\parser.c:14616)
TypeError: data type not understood

这是一个非常大的 csv(31k 行),所以也许这与它有关?

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5 回答 5

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这是pandas dtype guessing的问题。

Pandas 看到数字并猜测您希望它是数字。

为了让 pandas 不怀疑你的意图,你应该设置你想要的 dtype:object

pd.read_csv('filename.csv', dtype={'leading_zero_column_name': object})

会成功的

更新,因为它可以帮助其他人:

要将所有列作为 str,可以这样做(来自评论):

pd.read_csv('sample.csv', dtype = str)

要将大多数或选择性列作为 str,可以这样做:

# lst of column names which needs to be string
lst_str_cols = ['prefix', 'serial']
# use dictionary comprehension to make dict of dtypes
dict_dtypes = {x : 'str'  for x in lst_str_cols}
# use dict on dtypes
pd.read_csv('sample.csv', dtype=dict_dtypes)
于 2016-05-26T07:27:36.603 回答
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在解析带有序列号的文件时,这个问题让我很头疼。由于未知原因,00794 和 000794 是两个不同的序列号。我最终想出了

converters = {'serial_number': str}
于 2013-07-27T23:46:44.810 回答
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如果您不希望它成为对象,您似乎必须指定字符串的长度。
例如:

dtype={'USAF': '|S6'}

我找不到这方面的参考资料,但我似乎记得 Wes 正在讨论这个问题(也许在一次谈话中)。他建议 numpy 不允许“正确的”可变长度字符串(请参阅此问题/答案),并且使用最大长度来填充数组通常会导致空间效率低下(即使字符串很短它也会使用与最长字符串一样多的空间)。

正如@Wes 指出的那样,这也是一种情况:

dtype={'USAF': object}

也可以。

于 2013-06-05T00:14:47.750 回答
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您可以将函数字典传递给converters键是数字列索引的地方。因此,如果您不知道列名是什么,您可以这样做(前提是您的列数少于 100)。

pd.read_csv('some_file.csv', converters={i: str for i in range(100)})

于 2018-09-03T23:17:10.887 回答
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使用 Pandas 1,如何:

df.read_csv(..., dtype={"my_confusing_col": "string"})

请注意,这将string使用pd.NA用于任何缺失值的列 dtype。当然,所有前导零都会被保留。

于 2020-05-15T17:15:51.697 回答