我想自动生成几百个散点图,但我在处理子集的紧凑方法方面没有取得多大成功。数据框具有三个感兴趣的字段:
site code value
1 x 30
1 y 14
1 z 12
2 x 35
2 y 19
ETC,
其中站点 = 数字,值 = 数字,代码 = 分组变量。
大约有 400 个站点和 300 个代码。
我想要的是:
- 根据字段 =code 对 df 进行子集化
- 绘制 x=site vs y=value,作为散点图
- 将每个散点图写入 .pdf 中的单独页面
- 自动化流程
任何意见表示赞赏。例如,这种方法会生成错误“子集”必须评估为逻辑。lapply 调用也可能不起作用。
dfarray<-list(subset(df,df[,2]))
pdf(file="test.pdf")
figures<-lapply(dfarray, function(i) {(plot(i$[,1],i$[,3]))
})
dev.off()
非常感谢
合并 d_ply 效果很好。我对这个结果很满意,但是谁能指出 X、Y 轴的标签声明有什么问题?(注意:此代码块导致每个子集 1 个 pdf)
names(df)<-tolower(names(df))
names(df)
d_ply(df,"code",function(x){
pdf(file=paste(unique(x$code),".pdf"))
plot(data=x,value~site, xlab=names(x[1]),ylab=as.name(x$code))
dev.off()
})
更新:假设数据框 df 存在,以下是此代码的两个功能版本。这个将每个组的散点图写入单独的.pdf:
names(df)<-tolower(names(df)
names(df)
d_ply(df,"code",function(x){
pdf(file=paste(unique(x$code),".pdf"))
plot(data=x, value~site, xlab=names(df[1]),ylab=unique(x$code))
dev.off()
})
这个将所有散点图(每组一个)写入单个 .pdf:
names(df)<-tolower(names(df)
names(df)
pdf(file="df_all.pdf")
d_ply( df, "code", function(x) {
plot(data=x, value~site, xlab=names(df[1]), ylab=unique(x$code))
})
dev.off()