r - R 不再并行运行

Question

我运行 (k)Ubuntu 12.04.2 和 R 3.0.1

我写了一堆过去并行运行的代码，但现在不再并行了。甚至这不再并行运行：

library(doMC)
registerDoMC(4)
Results = foreach (i = 1:1e6, .combine = "c") %dopar% {
  sqrt(i)
}

这绝对应该。我认为破坏它的是 R 3.0.1 更新或-dev, -devel我安装的 BLAS 包。（我认为是openBLAS）

我已经system(sprintf("taskset -p 0xffffffff %d", Sys.getpid()))按照其他地方的建议进行了尝试，并得到了这个结果：

pid 2415's current affinity mask: 1
pid 2415's new affinity mask: f

我还尝试使用以下命令运行 R：

taskset 0xffff R

然而，在运行这些步骤中的任何一个之后，循环仍然只使用一个内核。

我想要并行处理！我怎么才能得到它？

score 2 · Accepted Answer

我找到了解决方案！具有讽刺意味的是，为了恢复并行处理，我必须同时执行我在 Q 中提到的两个步骤

所以，从 R 开始

taskset 0xffff R

然后运行

system(sprintf("taskset -p 0xffffffff %d", Sys.getpid()))

R内。

瞧，并行处理返回

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