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再会。

我使用 Grep 根据 ID 文件的模式从文件中提取读数。

grep -w -f idFile.txt readingFile.txt

我得到的 Grep 的输出是：

F47807  0.00    0.00    8.30
R02218  0.00    0.00    2.07
W74941  0.00    0.00    5.70
C15915  0.00    0.00    3.63
C16638  0.00    0.39    8.82
C16979  0.00    0.39    2.59

假设 ID 文件是：

W74941
F47807
C15915
R02218
C16638
C16979

我希望 Grep 输出与 ID 文件相同的模式，如下所示：

W74941  0.00    0.00    5.70
F47807  0.00    0.00    8.30
C15915  0.00    0.00    3.63
R02218  0.00    0.00    2.07
C16638  0.00    0.39    8.82
C16979  0.00    0.39    2.59

我尝试了几个 Grep 选项，但我没有得到我想要的。因此，社区能否请给我一些建议，我该怎么做？

非常感谢您的宝贵时间。

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3 回答 3

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我不知道你是否可以只用 grep 来做到这一点，但如果你使用一点 bash，你可以这样做：

for line in $(cat idFile.txt)
    do grep "$line" readingFile.txt
done

不过，这将为每个 id 遍历一次 readingFile，因此如果担心性能，这将无济于事。

编辑：请注意，这假设 id 不包含空格。

于 2013-05-27T19:57:06.267 回答
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用一点点awk你可以做这样的事情 -

awk 'NR==FNR {
    a[$1]=$0
    next 
} 
($1 in a) { 
    print a[$1] 
}' <(grep -w -f idFile.txt readingFile.txt) idfile

解释：

  • awk是/pattern/ {action}语句的组合。我们的第一个模式NR==FNR确保我们的操作仅在传递给 awk 的第一个文件上执行（在我们的例子中是 grep 输出）。
  • 我们action的目的是将它存储在一个数组中。
  • 一旦第一个文件完成，我们的模式将变为错误，第二个pattern-action语句将生效。
  • 第二个pattern-action语句检查您的 idfile 的第一个条目是否存在于数组中。如果是，它会打印它。结果，您将根据 idfile.xml 中找到的序列获得输出。
于 2013-05-27T20:23:49.647 回答
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这个单行应该与您的 grep 输出和 idfile 一起使用：

awk 'NR==FNR{a[$1]=$0;next}$1 in a&&$0=a[$1]'

完整行：

awk 'NR==FNR{a[$1]=$0;next}$1 in a&&$0=a[$1]' <(grep -w -f idFile.txt readingFile.txt) idfile
于 2013-05-27T20:44:21.123 回答