1

我想使用RcppArmadillo. 正如我在另一篇关于 SO 的文章中所读到的,如果RcppArmadillo.h包含,Rcpp.h则不应包含在内。我就是这样做的,但是在尝试编译.cpp文件时,我收到了一些错误消息。编辑。根据 Dirk 的建议,我只包括RcppArmadillo.h,这大大减少了错误消息的数量: 最低限度可重现的代码如下:

#include <RcppArmadillo.h>
// [[Rcpp::depends(RcppArmadillo)]]

using namespace Rcpp;
using namespace arma;

template <class RandomAccessIterator, class StrictWeakOrdering>
void sort(RandomAccessIterator first, RandomAccessIterator last, StrictWeakOrdering comp);

struct val_order{
        int order;
        double value;
};

bool compare(const val_order & a, const val_order & b){return (a.value<b.value);}

// [[Rcpp::export]]
IntegerVector order(NumericVector x){
    int n=x.size();
    std::vector<int> output(n);
    std::vector<val_order> index(n);
    for(int i=0;i<x.size();i++){
        index[i].value=x(i);
        index[i].order=i;
    }
    std::sort(index.begin(), index.end(), compare); 
    for(int i=0;i<x.size();i++){
        output[i]=index[i].order;
    }
    return wrap(output);
}

错误信息如下:

Error in sourceCpp("functions.cpp") : 
  Error 1 occurred building shared library.
ld: warning: directory not found for option '-L/usr/local/lib/gcc/i686-apple-darwin8/4.2.3/x86_64'
ld: warning: directory not found for option '-L/usr/local/lib/x86_64'
ld: warning: directory not found for option '-L/usr/local/lib/gcc/i686-apple-darwin8/4.2.3'
ld: library not found for -lgfortran
collect2: ld returned 1 exit status
make: *** [sourceCpp_44748.so] Error 1

重申一下,这段代码在我使用Rcpp.h.

4

1 回答 1

1

一些东西:

  1. 你的帖子没有帮助。我们不需要几十行错误信息,但我们确实需要可重现的代码。你没有包括在内。

  2. 您包括几个 C++ 头文件几个 R 头文件。不。

  3. 仅包含一个标头:RcppArmadillo.h,如果失败,请发布可重现的示例。

编辑:感谢您的更新。您的代码现在可以编译,您的错误是链接器错误。您只需要在 OS X 下安装 Fortran 编译器。

于 2013-05-20T13:05:49.563 回答