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我正在使用 HDF5 C++ API。我有一个程序偶尔需要编写大于 64 kB 的属性。尝试编写如此大的属性时,它会引发 H5::AttributeIException。

HDF5 文档提到了两种存储大型属性的方法。第一个选项是密集存储(我认为从 1.8.8 版开始可用),而第二个选项是将属性中的数据卸载到其他数据集,并将对该数据集的引用存储在属性中。第二个选项应该是向后兼容的,而第一个选项破坏了与 1.8.8 之前的 HDF5 版本的兼容性。

不幸的是,似乎没有任何关于如何在 C++ 中实现这些选项的文档。我试图通过将 C API 与 C++ API 相结合来破解第一个选项。这是我的尝试,基于此处的密集存储示例:

hid_t dID = dataset->getId();
herr_t res = H5Pset_attr_phase_change(dID, 0, 0);
if(res < 0) {
    std::cerr << "Failed to specify dense storage." << std::endl;
}

在这里,dataset 是一个 H5::DataSet 对象。此代码无法设置密集存储,如 res 始终为负数所示。我认为这可能是因为我没有像密集存储的 C 示例中那样指定 H5F_LIBVER_LATEST 之类的内容:

fpid = H5Pcreate (H5P_FILE_ACCESS);
status = H5Pset_libver_bounds (fpid, H5F_LIBVER_LATEST, H5F_LIBVER_LATEST);
fid = H5Fcreate("adense.h5", H5F_ACC_TRUNC, H5P_DEFAULT, fpid);

我在 C++ API 中找不到任何方法来指定 H5F_LIBVER_LATEST。据我从文档中得知,H5::FileAccPropList 类没有任何类似于 set_libver_bounds 的成员函数。

至于第二个选项,将属性存储为对辅助数据集的引用,我不知道从哪里开始,因为 C++ 文档中没有这样的示例。

有谁知道如何在 C++ 中实现密集存储或将属性存储为对数据集的引用?

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H5::FileAccPropList有一个重载的构造函数,它允许对象继承(或者更确切地说是包装)一个现有的文件访问属性列表,该列表是使用 C API 创建的。因此,您应该能够执行以下操作:

hid_t fapl = H5Pcreate(H5P_FILE_ACCESS);
H5Pset_libver_bounds(fapl, H5F_LIBVER_LATEST, H5F_LIBVER_LATEST);
H5::FileAccPropList faplObj(fapl);
...
于 2013-05-27T10:09:35.710 回答
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供将来参考:

有一种方法可以设置 lib 版本(使用 C++ API):

void H5::FileAccPropList::setLibverBounds   (H5F_libver_t   libver_low,
                                             H5F_libver_t   libver_high 
                                            ) const

链接

于 2018-04-09T12:29:12.833 回答
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(没有足够的代表来评论这个问题)。

根据https://support.hdfgroup.org/HDF5/doc/RM/RM_H5P.html#Property-SetAttrPhaseChange ,在 HDF5 1.8.0 版本中引入了属性的密集存储功能。

于 2017-02-01T22:49:43.747 回答