python - 通过 f2py 对 Python 的 Fortran 扩展：如何分析？

Question

我正在使用通过 f2py（版本 2）编译的 Fortran（gfortran 4.4.7）编写的 Python（2.7.2）扩展。

我可以用 来分析 Python 部分cProfile，但结果没有提供有关 Fortran 函数的任何信息。相反，时间归因于调用 Fortran 函数的 Python 函数。

我已经为我构建的所有 Fortran 对象启用了“-pg -O”标志，以及在 f2py 调用中通过以下方式创建共享对象：f2py --opt="-pg -O"...

任何有关如何获取 Fortran 信息的提示都非常感谢。

如果有人使用类似的设置，使用不同的分析器，我也会感兴趣。

Answer 1

看看 python 扩展分析器是的。

Answer 2

Fortran 函数调用显示为：

<ipython-input-51-f4bf36c6a947>:84(<module>). 

我知道，您无法确定正在调用哪个模块，但至少这给了您一个想法。

另一种方法是将其包装到 Python 函数中，然后查看 Python 函数的时序。

Answer 3

此工作流程似乎运行良好：

• 1. 使用callgrind分析您的代码（这会生成一个类似于 callgrind.out.27237 的文件）：

valgrind --tool=callgrind python my_python_script_calling_f2py_functions.py arg1 arg2

• 2. 转换为.dot 文件 （如果需要，您可以使用以下命令安装 gprof2dot：“pip install git+ https://github.com/jrfonseca/gprof2dot ”）

gprof2dot -f callgrind callgrind.out.27237 > callgrind.dot

• 3. 使用 graphviz创建一个图（请参阅这个 stackoverflow 问题Interpreting callgrind data）：

dot -Tjpg callgrind.dot -o callgrind.jpg