r - 提取数字 R 后从两列中选择更高的值

Question

我有一个数据框（8 个变量的 451 个 obs），它有两列（6 和 7），如下所示：

  Major      Minor
  C:726      T:2
  A:687      G:41
  T:3        C:725

我想创建一个总结这一点的专栏。为此，我不关心每个单元格中的字母，但我希望保留更大的数字，无论它在哪一行。即我希望它看起来像这样：

  Summary_column
  726
  687
  725

没必要，但对于那些想知道我在做什么的人来说，这是一个名为 VCFtools 的程序的输出；它有一个计数功能，可以计算 VCF 中的等位基因，但有时当等位基因明显更常见时，它会将等位基因命名为“次要”。

谢谢你的帮助！

score 3 · Accepted Answer

我会做这样的事情：

extract <- function(v) {
  gsub("^.*:", "", v)
}
within(d, Summary_column <- pmax(extract(Major), extract(Minor)))

这使：

  Major Minor Summary_column
1 C:726   T:2            726
2 A:687  G:41            687
3   T:3 C:725            725

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