r - 如何在 R 中创建精细的色标，以使用 igraph 绘制节点颜色？

Question

我正在使用 igraph 在 R 上绘制一个小型网络（21 个节点）。我希望节点根据向量 postMean 着色，该向量具有以下值：

[1] -0.035275268  0.016065216 -0.009860104 -0.110333756  0.027173563

[6]  0.003732149 -0.015728577 -0.015447753 -0.015458429 -0.031747722

[11]  0.050184673  0.052410534  0.025986002  0.059460753  0.044158671

[16] -0.302219356  0.065311113  0.012006393  0.019186883 -0.006812400

[21]  0.196030557

当数字很小时，如何调整颜色的比例以指示 postMean 向量的值？我想要一个非常好的灰度，但目前我似乎能得到的只是一些节点是白色的，一些节点是黑色的。

提前谢谢了。

Answer 1

您可以使用rescale()plotrix 包中的函数将矢量从 0 重新缩放到 1，然后使用该gray()函数将这些转换为灰度颜色。

library(igraph)
library(plotrix)
vcol <- gray(rescale(postMean, c(0, 1)))
tkplot(graph, vertex.color=vcol)

如果您不希望颜色范围一直扩展到黑色和白色，则可以缩小重新缩放到的值范围，例如：

vcol <- gray(rescale(postMean, c(0.1, 0.9)))