r - 具有多个元素的向量的公共元素

Question

如何有效地找到具有重复元素的两个向量的共同元素？

例子：

v1 <- c(1, 1, 2, 3, 3, 4)  
v2 <- c(1, 1, 1, 3, 4, 5)  
commonElements <- c(1, 1, 3, 4)

intersect不能很好地处理重复元素。

Answer 1

我喜欢intersect和tables，所以...

tv1 <- table(v1)
tv2 <- table(v2)
comvals <- intersect(names(tv1),names(tv2))
comtab <- apply(rbind(tv1[comvals],tv2[comvals]),2,min)

信息仍然存在，但（我认为）格式更好：

> comtab
1 3 4 
2 1 1 

编辑：不过，如果你真的想要那个向量，它是：as.numeric(rep(names(comtab),comtab))。

Answer 2

这是另一种选择：

common <- function(v1, v2) {
  lvls <- unique(c(v1, v2))
  v1a <- factor(v1, levels=lvls)
  v2a <- factor(v2, levels=lvls)
  v <- pmin(table(v1a), table(v2a))
  as.numeric(rep(names(v), v))
}

common(rep(1:3, 1:3), rep(1:2, 1:2))
[1] 1 2 2

common(rep(c(1,3,5), 1:3), rep(c(5,2), 2))
[1] 5 5

编辑：包装一个函数，演示不同的案例并根据@Dason 的评论加快速度

Answer 3

我确信有很多方法可以做到这一点，但我选择对其进行排序并用于rle获取值和计数。 table也可能完成同样的任务。

common <- function(v1, v2){
  r1 <- rle(sort(v1))
  r2 <- rle(sort(v2))
  vals <- intersect(r1$values, r2$values)
  l1 <- r1$lengths[r1$values %in% vals]
  l2 <- r2$lengths[r2$values %in% vals]
  rep(vals, pmin(l1, l2))
}

common(v1, v2)

一些例子

> common(v1, v2)
[1] 1 1 3 4
> common(c(1,1), c(3,2,1,3,1))
[1] 1 1
> common(c(1,2,3,2), c(1,2,3))
[1] 1 2 3