r - 删除所有 R 不附带的包

Question

如何删除除baseand之外的所有已安装软件包recommended？

Answer 1

当心！并在尝试之前阅读文档：

# Pasted as a commented to prevent blindly copying and pasting
# remove.packages( installed.packages( priority = "NA" )[,1] )

默认情况下，这将从您的.libPaths().

Answer 2

代替

更新到 R 3.0.0 并且必须重建所有包。

做就是了

update.packages(..., checkBuilt=TRUE)

这就是我在 R 3.0.0 上所做的（lib.loc=...用来指向我不同的本地目录）。这将更新您拥有的所有内容，以及仍然可以从CRAN 等存储库中获得的所有内容。对于install_git()等，你运气不好，需要重新安装。

但无论哪种方式，您都不需要先删除软件包。

Answer 3

接受的答案不再有效（R 3.6.X），但这个答案：

update.packages(checkBuilt = T, ask = F)

我们使用checkBuilt=T它是因为它检查包是否是在旧版本下构建的并且需要重新构建（有时）。

我们之所以使用ask=F，是因为否则我们会收到每个令人讨厌的软件包的提示。

Answer 4

以下是 R-Blogger 中提供的解决方案：

# create a list of all installed packages
 ip <- as.data.frame(installed.packages())
 head(ip)
# if you use MRO, make sure that no packages in this library will be removed
 ip <- subset(ip, !grepl("MRO", ip$LibPath))
# we don't want to remove base or recommended packages either\
 ip <- ip[!(ip[,"Priority"] %in% c("base", "recommended")),]
# determine the library where the packages are installed
 path.lib <- unique(ip$LibPath)
# create a vector with all the names of the packages you want to remove
 pkgs.to.remove <- ip[,1]
 head(pkgs.to.remove)
# remove the packages
 sapply(pkgs.to.remove, remove.packages, lib = path.lib)

这是原始帖子的链接：https ://www.r-bloggers.com/how-to-remove-all-user-installed-packages-in-r/

Answer 5

如果在 Linux 上，最简单的方法可能是删除库文件夹，该文件夹默认位于/home/yourusername/R.

例如，在 Fedora 上，它被称为x86_64-redhat-linux-gnu-library. 如果文件夹/home/yourusername/R/x86_64-redhat-linux-gnu-library被删除，它会在 R 的以下启动时自动重新创建。所有默认库都定期可用。

Answer 6

警告，你会删除很多东西

有时卸载包不起作用，在这种情况下，您可能需要删除包所在的文件夹。假设您有权限，这可以从 R 完成。

sapply(paste(installed.packages( priority = "NA" )[, 2], installed.packages( priority = "NA" )[, 1], sep = "/"), unlink, recursive = T)

您可以通过以下方式预览要删除的路径：

sapply(paste(installed.packages( priority = "NA" )[, 2], installed.packages( priority = "NA" )[, 1], sep = "/"), identity)

这个电话：

• 获取已安装的非基础包列表
• 制作其安装路径的矢量
• 在路径上循环
• 递归删除每个文件夹