关于在特定数据集上调用 `write.table` 时崩溃 R的问题,我几乎可以通过在一个会话中R --vanilla
保存一个大数据,在 Windows-64位上“可靠地”崩溃 64 位。data.table
当我说差不多时,一旦发生(当向 IT 人员演示崩溃时!)我收到了消息
Error in .External2(C_writetable, x, file, nrow(x), p, rnames, sep, eol, :
'getCharCE' must be called on a CHARSXP
在上面的问题中引用。
要使 RI 崩溃,只需保存(DT,“datatablefile.RData”)
然后在另一个可能是的 R 会话中--vanilla
,我只是说...
load("datatablefile.RData")
write.csv(DT, file='datatablefile.csv')
然后会在一两分钟后崩溃。特别注意,如果我说它不会崩溃
load("datatablefile.RData")
library(data.table)
write.csv(DT, file='datatablefile.csv')
当我说类似的话
library(data.table)
N <- 1000
DT <- data.table(id=1:N, name=sample(letters, N, replace=TRUE))
save(DT, file='dttest.RData')
然后在另一个会话中
load('dttest.RData')
write.csv(DT, 'dttest.csv')
我不会撞车...
有可能与它有关的建议rbindlist()
,所以
library(data.table)
N <- 10000000
DT1 <- data.table(id=1:N, name=sample(letters, N, replace=TRUE))
DT2 <- data.table(id=1:N, name=sample(letters, N, replace=TRUE))
DT <- rbindlist(list(DT1, DT2))
save(DT, file='dttest.RData')
请注意,我已经N <- 10000000
在这台 32gb 机器上尝试过这个,它仍然可以正常工作......
有人建议可能是由于因素造成的?
library(data.table)
N <- 1000
DT1 <- data.table(id=1:N, name=sample(letters, N, replace=TRUE),
code=as.factor(sample(letters[1:5], N, replace=TRUE)))
DT2 <- data.table(id=1:N, name=sample(letters, N, replace=TRUE),
code=as.factor(sample(letters[1:5], N, replace=TRUE)))
DT <- rbindlist(list(DT1, DT2))
save(DT, file='dttest.RData')
str(DT)
Classes ‘data.table’ and 'data.frame': 20000000 obs. of 3 variables:
$ id : int 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 ...
$ name: chr "v" "u" "t" "z" ...
$ code: Factor w/ 5 levels "a","b","c","d",..: 2 5 4 2 2 1 2 3 2 4 ...
- attr(*, ".internal.selfref")=<externalptr>
然后在另一个会话中
> load('dttest.RData')
> tables()
Error: could not find function "tables"
> str(DT)
Classes ‘data.table’ and 'data.frame': 20000000 obs. of 3 variables:
$ id : int 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 ...
$ name: chr "v" "u" "t" "z" ...
$ code: Factor w/ 5 levels "a","b","c","d",..: 2 5 4 2 2 1 2 3 2 4 ...
- attr(*, ".internal.selfref")=<externalptr>
> write.csv(DT, 'dttest.csv')
然后工作正常...
当我写一个data.table
可以包含 chr、num、Date 但包含 Factors 时似乎失败的大文件时,这似乎很好......
关于我如何弄清楚如何创建一个如何复制它的可靠演示的任何建议?表格本身的内容是高度机密的。
更新 我刚刚尝试过
setkey(DT,id)
但这并没有导致崩溃。