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我无法import matplotlib._png

import matplotlib._png as _png ImportError: /home/james/opt/python/virtualenvs/work/lib/python2.7/site-packages/matplotlib-1.3.x-py2.7-linux-x86_64.egg/matplotlib/_png.so:未定义符号:png_set_longjmp_fn

此错误使我无法运行import pylab(因为这最终会导入matplotlib._png)。

matplotlib从源代码安装,并确保在运行之前将带有本地安装 ( /home/james/local) 的路径添加到basedirin 中。setupext.pypython setup.py install

REQUIRED DEPENDENCIES AND EXTENSIONS
                 numpy: yes [version 1.7.1]
              dateutil: yes [using dateutil version 2.1]
               tornado: yes [using tornado version 3.0.1]
             pyparsing: yes [using pyparsing version 1.5.7]
                 pycxx: yes [Couldn't import.  Using local copy.]
                libagg: yes [pkg-config information for 'libagg' could not
                        be found Using local copy.]
              freetype: yes [version 16.0.10]
                   png: yes [version 1.2.10]

到目前为止我的研究:

从上面可以看出,matplotlib 似乎找到1.2.10了版本,即使我拥有的版本/home/james/local1.6.2

$ find . -iname '*libpng*'                                                                                                  
./libpng16.so.16.1.0
./libpng16.so
./libpng16.so.16
./libpng16.a
./libpng.a
./libpng.so
./libpng16.la
./pkgconfig/libpng.pc
./pkgconfig/libpng16.pc
./libpng.la

更具体地说,我修改了以下行setupext.py

return basedir_map.get(sys.platform, ['/home/james/local', '/usr/local', '/usr'])

但是matplotlib似乎找到了系统版本:

$ locate libpng
/usr/lib/libpng.so
/usr/lib/libpng.so.3
/usr/lib/libpng.so.3.10.0
/usr/lib/libpng12.a
/usr/lib/libpng12.so
/usr/lib/libpng12.so.0
/usr/lib/libpng12.so.0.10.0

这可能是问题吗?为什么我无法导入matplotlib._png

更新:

看了一下setupext.py,好像是通过python setup install查询方法来确定我安装的libpng的版本。原来是返回系统安装:pkg-configSetupPackage_check_for_pkg_configpkg-config

$ pkg-config --libs libpng
-lpng12

即使我basedir在 matplotlib中进行了更新setupext.py,并LD_LIBRARY_PATH让它们指向libpng我在本地安装的更新版本。

关于如何pkg-config返回正确版本的任何想法?

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2 回答 2

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这是一个pkg-config问题;matplotlib 的安装(不幸的是,也许不是)过于依赖pkg-config's 的输出。

假设您以正常方式构建 libpng,您的 中应该有一个 pkgconfig 子目录/home/james/local/lib,其中包含libpng.pc(和libpng16.pc)。setupext.py运行时pkg-config,后者当然应该尝试.pc为 libpng 选择正确的文件。为此,请使用该PKG_CONFIG_PATH变量并将其指向 pkgconfig 子目录:

$ export PKG_CONFIG_PATH=/home/james/local/lib/pkgconfig

然后,再次安装 matplotlib,看看它现在找到了正确的 libpng 版本:

$ python setup.py build
basedirlist is: ['/usr/local', '/usr']
============================================================================
BUILDING MATPLOTLIB
            matplotlib: 1.1.0
                python: 2.7.4 (default, Apr  8 2013, 16:36:47)  [GCC 4.4.5]
              platform: linux2

REQUIRED DEPENDENCIES
                 numpy: 1.7.0
             freetype2: 12.0.6

OPTIONAL BACKEND DEPENDENCIES
                libpng: 1.6.1
               Tkinter: Tkinter: 81008, Tk: 8.4, Tcl: 8.4

(对我来说,当然使用不同的 PKG_CONFIG_PATH。是的,我可能想升级一些依赖项。)

请注意,我什至没有改变basedirlist;它只是默认设置。如果pkg-config现在无法获取其他包,只需添加更多目录,PKG_CONFIG_PATH并在其间添加冒号。但我想这应该足够了。

于 2013-04-26T14:35:45.357 回答
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尝试

 export LD_LIBRARY_PATH=/home/james/local/lib

然后执行 Matplotlib... 这会将 matplotlib 指向您的本地版本。

于 2013-04-26T01:35:20.733 回答